17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0021 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0021  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  219  9.999999999999999e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1306  type III restriction enzyme, res subunit family  67.19 
 
 		 786 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.986066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2244  type III restriction protein res subunit  69.84 
 
 		 788 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.450731  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0307  type III restriction protein res subunit  67.19 
 
 		 784 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2408  DEAD/DEAH box helicase, putative  77.19 
 
 		 809 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2039  type III restriction protein res subunit  77.19 
 
 		 809 aa  97.4  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0006  type III restriction enzyme, res subunit  64.91 
 
 		 768 aa  83.6  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2493  DEAD/DEAH box helicase-like  55.07 
 
 		 799 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1316  type III restriction enzyme, res subunit  51.72 
 
 		 796 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.262236  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0717  type III restriction protein res subunit  51.72 
 
 		 794 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0789  type III restriction protein res subunit  41.38 
 
 		 795 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.891259  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3698  transposase Tn3 family protein  76 
 
 		 974 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0861191  normal  0.131988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1457  type III restriction protein res subunit  33.82 
 
 		 971 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3271  type III restriction enzyme, res subunit  36.21 
 
 		 785 aa  43.9  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.581193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1095  putative transposase  51.16 
 
 		 332 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0110923 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4007  type III restriction protein res subunit  33.9 
 
 		 813 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527137  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3695  type III restriction protein res subunit  33.9 
 
 		 813 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>