177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1331 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  53.73 
 
 
137 aa  150  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  59.26 
 
 
141 aa  147  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  54.55 
 
 
137 aa  141  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  51.52 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  50.38 
 
 
135 aa  135  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  50 
 
 
137 aa  133  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  50 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  51.49 
 
 
137 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  47.37 
 
 
141 aa  130  6e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  52.24 
 
 
163 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  47.33 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  51.49 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  48.53 
 
 
141 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  49.25 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  48.89 
 
 
137 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  48.51 
 
 
137 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  47.01 
 
 
137 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  48.51 
 
 
137 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  46.67 
 
 
137 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  47.41 
 
 
138 aa  121  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  44.44 
 
 
137 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  43.7 
 
 
144 aa  120  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  48.55 
 
 
143 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  44.44 
 
 
142 aa  120  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  43.38 
 
 
142 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  45.93 
 
 
137 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  43.38 
 
 
142 aa  120  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  45.93 
 
 
141 aa  118  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  44.78 
 
 
140 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  43.08 
 
 
139 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  42.96 
 
 
137 aa  118  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  47.33 
 
 
148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  44.03 
 
 
140 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  41.91 
 
 
142 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  42.42 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  47.29 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  47.01 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  46.38 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  43.28 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  42.42 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  42.34 
 
 
143 aa  110  6e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  41.61 
 
 
139 aa  110  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  39.42 
 
 
142 aa  110  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  44.85 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  43.05 
 
 
154 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  45.39 
 
 
156 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  41.22 
 
 
133 aa  106  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  44.08 
 
 
173 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  38.24 
 
 
141 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  41.22 
 
 
138 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2770  protein of unknown function DUF55  43.45 
 
 
152 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0051852  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  40.15 
 
 
138 aa  101  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  44.37 
 
 
158 aa  100  7e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  40.26 
 
 
163 aa  99.8  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  41.72 
 
 
156 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  39.53 
 
 
135 aa  99  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  37.98 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  41.67 
 
 
152 aa  97.8  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01690  AT DNA binding protein (Thy28), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08590)  37.87 
 
 
324 aa  95.5  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.240865 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  39.87 
 
 
156 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  42.76 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  40.91 
 
 
158 aa  94.7  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5205  hypothetical protein  40.69 
 
 
149 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4320  protein of unknown function DUF55  40.69 
 
 
149 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000124301  hitchhiker  0.00573912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  41.38 
 
 
153 aa  94  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4260  protein of unknown function DUF55  40.69 
 
 
149 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  42.47 
 
 
152 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4432  hypothetical protein  39.46 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.830647  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  39.46 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  36.84 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  41.67 
 
 
146 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  35.81 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18281  hypothetical protein  41.35 
 
 
157 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  35.81 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5972  hypothetical protein  42.07 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  41.61 
 
 
158 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  41.67 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  41.67 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1677  hypothetical protein  37.09 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2609  hypothetical protein  39.33 
 
 
153 aa  90.9  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  41.67 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0960  hypothetical protein  40.44 
 
 
157 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.254439  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15461  hypothetical protein  37.96 
 
 
156 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.439189  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5113  hypothetical protein  40 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.839421  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1969  hypothetical protein  37.09 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  37.75 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  37.75 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  37.33 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0815  hypothetical protein  37.58 
 
 
160 aa  89.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.422094  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05161  hypothetical protein  44.74 
 
 
158 aa  89.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  35.56 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0353  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  88.6  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  37.93 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  36.91 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3975  protein of unknown function DUF55  36 
 
 
154 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.644317  normal  0.0207421 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  37.33 
 
 
152 aa  89.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1737  protein of unknown function DUF55  38.41 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2723  hypothetical protein  38.41 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2648  hypothetical protein  38.41 
 
 
153 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>