More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0089 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  100 
 
 
332 aa  684    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  89.38 
 
 
329 aa  608  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  80.63 
 
 
348 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  59.48 
 
 
320 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  62.54 
 
 
330 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  57.78 
 
 
324 aa  391  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  59.54 
 
 
310 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  57.96 
 
 
333 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  57.57 
 
 
310 aa  378  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  58.33 
 
 
322 aa  376  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  57 
 
 
334 aa  374  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.77 
 
 
332 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  56.21 
 
 
328 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  56.07 
 
 
323 aa  371  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  56.72 
 
 
323 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  55.56 
 
 
328 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  58.5 
 
 
320 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.41 
 
 
322 aa  368  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  53.8 
 
 
325 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.35 
 
 
317 aa  367  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  54.34 
 
 
325 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.89 
 
 
331 aa  364  1e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  54.93 
 
 
312 aa  357  9.999999999999999e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  56.03 
 
 
329 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  54.79 
 
 
304 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  54.13 
 
 
304 aa  351  1e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  54.07 
 
 
338 aa  350  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  54.46 
 
 
304 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.79 
 
 
310 aa  349  4e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  54.46 
 
 
304 aa  349  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  53.42 
 
 
313 aa  343  2e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  53.7 
 
 
314 aa  340  1e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  52.82 
 
 
311 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  51.13 
 
 
324 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  52 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  52.46 
 
 
315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  48.9 
 
 
322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  49.51 
 
 
323 aa  318  9e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  48.87 
 
 
319 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  49.2 
 
 
311 aa  312  3.9999999999999997e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  48.41 
 
 
321 aa  309  5e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.39 
 
 
307 aa  285  7e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.89 
 
 
303 aa  285  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.62 
 
 
341 aa  280  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.95 
 
 
301 aa  278  9e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  47.02 
 
 
324 aa  278  1e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2449  quinolinate synthetase  46.01 
 
 
382 aa  278  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  45.54 
 
 
301 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0746  quinolinate synthetase  46.15 
 
 
356 aa  275  7e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2197  quinolinate synthetase  47.91 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.293101  normal  0.563697 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2327  quinolinate synthetase  45.4 
 
 
382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0615138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  44.85 
 
 
307 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  45.99 
 
 
395 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0600  quinolinate synthetase  46.18 
 
 
379 aa  272  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.287851  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1928  quinolinate synthetase  47.45 
 
 
355 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0143239 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2717  quinolinate synthetase  45.08 
 
 
382 aa  272  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.88 
 
 
301 aa  272  7e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1426  quinolinate synthetase  46.79 
 
 
353 aa  271  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00168698  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0256  quinolinate synthetase  45.37 
 
 
357 aa  271  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1712  quinolinate synthetase  46.89 
 
 
355 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0567053 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  43.12 
 
 
358 aa  270  2e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1789  quinolinate synthetase  45.26 
 
 
355 aa  270  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0580  quinolinate synthetase  45.17 
 
 
376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916208  normal  0.575901 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0632  quinolinate synthetase  45.86 
 
 
379 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1901  quinolinate synthetase  46.47 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.115299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2326  quinolinate synthetase  45.79 
 
 
355 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00278867 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2243  quinolinate synthetase  44.95 
 
 
355 aa  269  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1888  quinolinate synthetase  45.89 
 
 
360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.683594  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.81 
 
 
298 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02681  quinolinate synthetase  44.75 
 
 
345 aa  268  8.999999999999999e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000074326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2025  quinolinate synthetase  46.2 
 
 
357 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  hitchhiker  0.0000127586 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1950  quinolinate synthetase  46.2 
 
 
357 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.692849  hitchhiker  0.00216399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1938  quinolinate synthetase  44.95 
 
 
355 aa  268  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.43657  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2128  quinolinate synthetase  46.2 
 
 
357 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.252809  hitchhiker  0.00117458 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2342  quinolinate synthetase  45.89 
 
 
357 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0793  quinolinate synthetase  43.25 
 
 
352 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0774972  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0476  quinolinate synthetase complex, A subunit  46.77 
 
 
361 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00468623  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4505  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
355 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2219  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
355 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000709559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2281  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
355 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.880932  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2152  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
355 aa  266  4e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000718643  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0730  quinolinate synthetase  43.87 
 
 
353 aa  266  4e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2202  quinolinate synthetase  45.25 
 
 
360 aa  265  8e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0931792  normal  0.199865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2232  quinolinate synthetase  45.57 
 
 
355 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.011888  hitchhiker  0.00937696 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2874  quinolinate synthetase  43.45 
 
 
384 aa  265  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2553  quinolinate synthetase  45.22 
 
 
378 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1282  quinolinate synthetase  45.37 
 
 
352 aa  264  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003910  quinolinate synthetase  45.81 
 
 
353 aa  263  2e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.717256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0221  quinolinate synthetase  43.64 
 
 
343 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  42.43 
 
 
303 aa  263  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1319  quinolinate synthetase  43.34 
 
 
378 aa  263  3e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0903  quinolinate synthetase  43.89 
 
 
377 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0026  quinolinate synthetase  44.34 
 
 
370 aa  262  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.44147  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2424  quinolinate synthetase  45.05 
 
 
378 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274031  hitchhiker  0.000442231 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0852  quinolinate synthetase  44.97 
 
 
344 aa  262  6e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000151704  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0852  quinolinate synthetase  45.9 
 
 
342 aa  262  6.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00075405  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  43.23 
 
 
308 aa  261  1e-68  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0804  quinolinate synthetase  44.65 
 
 
347 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282158  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3497  quinolinate synthetase  44.66 
 
 
374 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0545578  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2953  quinolinate synthetase  45.22 
 
 
353 aa  260  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000127352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>