32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3287 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  34.22 
 
 		 179 aa  104  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  35.63 
 
 		 182 aa  92.4  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  89.4  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  32.2 
 
 		 195 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  32.2 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  33.51 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  34.55 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  34.55 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  32.77 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  32.77 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  32.77 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  38.97 
 
 		 184 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  32.53 
 
 		 484 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 482 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  33.14 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  27.92 
 
 		 499 aa  54.3  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  38.94 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  35.59 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  27.75 
 
 		 508 aa  51.6  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  26.79 
 
 		 505 aa  50.8  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  27.71 
 
 		 508 aa  50.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  26.62 
 
 		 478 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  27.71 
 
 		 508 aa  50.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  27.54 
 
 		 504 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1547  disulphide bond formation protein DsbB  40.48 
 
 		 167 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  37.25 
 
 		 172 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  38.04 
 
 		 168 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  35.35 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0287  disulphide bond formation protein DsbB  27.27 
 
 		 478 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3658  disulphide bond formation protein DsbB  27.27 
 
 		 478 aa  41.2  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>