28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2074 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  98.53 
 
 
206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  99.51 
 
 
206 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  98.04 
 
 
204 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  48.11 
 
 
195 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  46.74 
 
 
195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  41.81 
 
 
179 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  39.56 
 
 
187 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  39.77 
 
 
184 aa  128  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  37.01 
 
 
182 aa  125  5e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  43.75 
 
 
182 aa  112  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  43.75 
 
 
182 aa  111  8.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  37.59 
 
 
135 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  32.77 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  30.86 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  29.55 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  29.55 
 
 
208 aa  54.7  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  24.4 
 
 
478 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  23.7 
 
 
484 aa  48.1  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  27.17 
 
 
482 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  26.36 
 
 
504 aa  46.2  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  27.37 
 
 
505 aa  43.5  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  23.5 
 
 
499 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  26.21 
 
 
508 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  26.21 
 
 
508 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  26.21 
 
 
508 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  44.58 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  38.82 
 
 
169 aa  41.6  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.390731 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>