29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6778 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  396  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  93.85 
 
 		 195 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  47.34 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  46.74 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  46.74 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  46.74 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  42.54 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  38.95 
 
 		 179 aa  135  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  39.75 
 
 		 182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  38.79 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  36.94 
 
 		 182 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  36.94 
 
 		 182 aa  98.2  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  34.35 
 
 		 135 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  32.2 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  34.5 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  29.38 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  28.87 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  30.46 
 
 		 482 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  28.19 
 
 		 484 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  30.16 
 
 		 528 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  39.81 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  26.67 
 
 		 499 aa  44.7  0.0008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  27.13 
 
 		 508 aa  44.7  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  21.23 
 
 		 478 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  24.69 
 
 		 505 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  30.7 
 
 		 508 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  30.7 
 
 		 508 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  34.69 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  24.85 
 
 		 504 aa  42  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>