22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1646 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  100 
 
 
499 aa  1015    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  45.19 
 
 
504 aa  442  1e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  45.51 
 
 
508 aa  430  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  45.51 
 
 
508 aa  427  1e-118  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  45.31 
 
 
508 aa  426  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  45.29 
 
 
505 aa  424  1e-117  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  31.53 
 
 
484 aa  225  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  30.18 
 
 
482 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  32.19 
 
 
478 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  31.42 
 
 
528 aa  206  1e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3658  disulphide bond formation protein DsbB  31.7 
 
 
478 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0287  disulphide bond formation protein DsbB  31.7 
 
 
478 aa  193  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2314  hypothetical protein  27.3 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.643915  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  26.74 
 
 
179 aa  60.5  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  27.27 
 
 
197 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  30.16 
 
 
135 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2158  disulphide bond formation protein DsbB  32.43 
 
 
150 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00152607 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  23.68 
 
 
182 aa  47.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  28.48 
 
 
195 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  26.67 
 
 
195 aa  44.7  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  27 
 
 
187 aa  43.5  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  25.79 
 
 
184 aa  43.5  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.402218 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>