32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II1062 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  66.48 
 
 		 179 aa  259  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  66.67 
 
 		 135 aa  210  1e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  39.44 
 
 		 195 aa  143  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  45.2 
 
 		 187 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  38.12 
 
 		 195 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  41.21 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  37.5 
 
 		 204 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  37.5 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  37.5 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  40.13 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  39.47 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  35.63 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  33.54 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  33.54 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  29.82 
 
 		 215 aa  67.8  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  25.55 
 
 		 484 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  27.01 
 
 		 482 aa  64.7  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  24.44 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  27.54 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  25.16 
 
 		 505 aa  53.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  25.32 
 
 		 528 aa  50.4  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  23.68 
 
 		 499 aa  47.4  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  25.16 
 
 		 508 aa  45.8  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0287  disulphide bond formation protein DsbB  24.44 
 
 		 478 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3658  disulphide bond formation protein DsbB  24.44 
 
 		 478 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3111  disulfide bond formation protein B  35.53 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  23.87 
 
 		 508 aa  45.1  0.0006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  23.87 
 
 		 508 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  28.36 
 
 		 1210 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6002  disulfide bond formation protein  38.96 
 
 		 163 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.154587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>