29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4643 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  93.85 
 
 
195 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  48.15 
 
 
204 aa  167  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  48.11 
 
 
206 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  48.17 
 
 
206 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  48.17 
 
 
204 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  46.02 
 
 
184 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  38.95 
 
 
179 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  40.37 
 
 
182 aa  134  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  38.55 
 
 
187 aa  122  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  35.44 
 
 
182 aa  102  5e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  37.97 
 
 
182 aa  100  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  34.35 
 
 
135 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  32.2 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  32 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  29.35 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  28.8 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  27.33 
 
 
484 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  29.05 
 
 
482 aa  55.5  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  30.16 
 
 
528 aa  49.7  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  25.53 
 
 
505 aa  47.4  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  20.83 
 
 
478 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  39.81 
 
 
169 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  28.48 
 
 
499 aa  46.2  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  26.36 
 
 
508 aa  45.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  24.57 
 
 
504 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  29.06 
 
 
508 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  29.06 
 
 
508 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  39.44 
 
 
169 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>