18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1256 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  100 
 
 
215 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  58.71 
 
 
208 aa  228  6e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  62.09 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  34.5 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  32 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  29.76 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  31.67 
 
 
187 aa  67.8  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  29.48 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  32 
 
 
204 aa  63.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  31.43 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  30.86 
 
 
204 aa  58.5  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  30.86 
 
 
206 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  35.59 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  31.25 
 
 
184 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  30.51 
 
 
482 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  32.9 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  31.37 
 
 
182 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  27.48 
 
 
135 aa  45.4  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>