31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0474 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  99.45 
 
 
182 aa  364  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  39.41 
 
 
179 aa  143  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  41.67 
 
 
187 aa  140  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  42.2 
 
 
206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  38.12 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  42.61 
 
 
204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  42.2 
 
 
204 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  42.2 
 
 
206 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  41.14 
 
 
184 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  37.06 
 
 
195 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  36.31 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  41.73 
 
 
135 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  34.43 
 
 
197 aa  98.2  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  32.12 
 
 
215 aa  64.3  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  27.33 
 
 
499 aa  57.8  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  29.2 
 
 
484 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  26.47 
 
 
482 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  31.33 
 
 
208 aa  55.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  31.52 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  21.64 
 
 
478 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02553  disulfide bond formation protein B  35.29 
 
 
172 aa  48.9  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.240277  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  23.27 
 
 
504 aa  47  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  26.97 
 
 
505 aa  45.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  24.07 
 
 
508 aa  44.3  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2653  disulphide bond formation protein DsbB  31.4 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0734912  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  24.72 
 
 
508 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  24.72 
 
 
508 aa  42.4  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3018  DsbB family disulfide bond formation protein  30.88 
 
 
1210 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1805  disulfide bond formation protein B  29.17 
 
 
173 aa  41.6  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0937244  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1478  disulphide bond formation protein DsbB  32.76 
 
 
159 aa  41.2  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>