27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1445 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A2020  hypothetical protein  99.51 
 
 		 206 aa  403  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618723 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1445  putative inner membrane protein  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.575083  normal  0.436473 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2074  hypothetical protein  98.04 
 
 		 204 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2012  hypothetical protein  97.55 
 
 		 206 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  0.118856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  48.15 
 
 		 195 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  47.34 
 
 		 195 aa  174  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  41.24 
 
 		 179 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1317  hypothetical protein  40.11 
 
 		 187 aa  138  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.521983  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  39.01 
 
 		 184 aa  127  9.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  37.01 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0450  hypothetical protein  42.61 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0474  hypothetical protein  42.61 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  35.38 
 
 		 135 aa  95.1  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  32.77 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1256  disulfide bond formation protein DsbB, putative  32 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.521027  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0324  putative disulfide bond formation protein DsbB  30.13 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0357  disulfide bond formation protein DsbB, putative  30.13 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  24.4 
 
 		 478 aa  48.9  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  24.11 
 
 		 482 aa  48.5  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  23.7 
 
 		 484 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  25.45 
 
 		 504 aa  45.1  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  23.76 
 
 		 499 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  26.32 
 
 		 505 aa  42.7  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  25.24 
 
 		 508 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  25.24 
 
 		 508 aa  41.6  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3040  disulfide bond formation protein B  44.58 
 
 		 169 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0055953 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  25.24 
 
 		 508 aa  41.6  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>