20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0287 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3658  disulphide bond formation protein DsbB  98.95 
 
 		 478 aa  976    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0287  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 478 aa  984    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2550  disulphide bond formation protein DsbB  93.93 
 
 		 478 aa  931    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3828  disulphide bond formation protein DsbB  39.54 
 
 		 482 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3914  disulphide bond formation protein DsbB  37.92 
 
 		 484 aa  346  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1646  DsbB family disulfide bond formation protein  31.94 
 
 		 499 aa  206  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0944829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0017  DsbB family disulfide bond formation protein  28.77 
 
 		 508 aa  187  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0044  DsbB family disulfide bond formation protein  28.66 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0017  DsbB family disulfide bond formation protein  28.66 
 
 		 508 aa  184  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1681  DsbB family disulfide bond formation protein  26.91 
 
 		 504 aa  176  9.999999999999999e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1512  disulfide bond formation protein, DsbB family  26.93 
 
 		 505 aa  172  1e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1346  disulfide bond formation protein, DsbB family  24.05 
 
 		 528 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.29334  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2314  hypothetical protein  26 
 
 		 297 aa  88.2  3e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.643915  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1062  membrane protein  24.44 
 
 		 182 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.166999  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06528  hypothetical protein  25.34 
 
 		 179 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3287  hypothetical protein  28.21 
 
 		 197 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.671731  hitchhiker  0.0042483 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6778  hypothetical protein  22.92 
 
 		 195 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4643  hypothetical protein  21.53 
 
 		 195 aa  47  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.155157  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_003296  RS04712  hypothetical protein  24.14 
 
 		 184 aa  44.3  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.402218 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06525  hypothetical protein  25.22 
 
 		 135 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>