34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3177 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3177  peptidase  100 
 
 
344 aa  685    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2955  peptidase  80.75 
 
 
346 aa  508  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.869876  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2441  peptidase alpha-lytic pro domain protein  62.06 
 
 
349 aa  358  9e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000713419  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0022  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  51.59 
 
 
387 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03540  Trypsin  47.23 
 
 
366 aa  218  8.999999999999998e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.528018  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19510  trypsin family protease proenzyme  44.12 
 
 
381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.257743  normal  0.125325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3147  Ricin B lectin  39.1 
 
 
522 aa  176  6e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.189477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2942  Ricin B lectin  39.87 
 
 
488 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0106304  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.31 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.520156 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4515  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.94 
 
 
378 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0335182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5805  peptidase, S1E (streptogrisin A) subfamily  38.66 
 
 
374 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.468539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1492  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.86 
 
 
384 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0362438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8918  hypothetical protein  38.54 
 
 
500 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1850  Ricin B lectin  37.77 
 
 
496 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.834953  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2479  streptogrisin C  40.74 
 
 
501 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0239994  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8916  streptogrisin C  38.59 
 
 
499 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8919  hypothetical protein  39.3 
 
 
507 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0484  streptogrisin C. Serine peptidase. MEROPS family S01A  39.22 
 
 
368 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8915  streptogrisin C  37.22 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0814  peptidase alpha-lytic pro domain-containing protein  36.7 
 
 
399 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1493  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.18 
 
 
381 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.03081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8917  streptogrisin C  36.22 
 
 
500 aa  142  8e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7728  streptogrisin C  35.06 
 
 
503 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.65 
 
 
457 aa  123  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1565  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.21 
 
 
494 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1566  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.86 
 
 
380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4297  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.59 
 
 
368 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04150  Trypsin  34.16 
 
 
392 aa  102  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0409839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4796  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.48 
 
 
220 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0366  hypothetical protein  28.81 
 
 
373 aa  54.3  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6012  hypothetical protein  39.13 
 
 
217 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3456  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.57 
 
 
800 aa  47.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6300  hypothetical protein  27.25 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2406  hypothetical protein  38.39 
 
 
348 aa  44.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>