20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3081 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3081  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362203  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4410  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 
314 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0362024  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0038  aminoglycoside phosphotransferase  41.22 
 
 
298 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0165  aminoglycoside phosphotransferase  41.45 
 
 
313 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0157854  normal  0.0703519 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00570  predicted aminoglycoside phosphotransferase  38.59 
 
 
295 aa  188  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254849  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7275  hypothetical protein  35.54 
 
 
298 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271977  normal  0.163129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7614  hypothetical protein  36.63 
 
 
302 aa  136  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.883884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1225  aminoglycoside phosphotransferase  29.47 
 
 
302 aa  132  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2661  aminoglycoside phosphotransferase  35.45 
 
 
303 aa  130  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2690  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 
301 aa  123  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00019331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1106  aminoglycoside phosphotransferase  31.82 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577893  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2376  hypothetical protein  30.96 
 
 
304 aa  109  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.149878 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3449  aminoglycoside phosphotransferase  29.62 
 
 
256 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2078  aminoglycoside phosphotransferase  28.23 
 
 
288 aa  63.5  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0430527  normal  0.448364 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1555  aminoglycoside phosphotransferase  27.98 
 
 
273 aa  57  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.312642  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5647  aminoglycoside phosphotransferase  30.34 
 
 
296 aa  54.3  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2030  hypothetical protein  30.05 
 
 
285 aa  53.9  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.528688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3466  aminoglycoside phosphotransferase  27.18 
 
 
295 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2109  aminoglycoside phosphotransferase  19.23 
 
 
306 aa  47.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4899  aminoglycoside phosphotransferase  32.73 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>