More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0619 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
293 aa  580  1e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.06874e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0924  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  73.79 
 
 
291 aa  437  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  7.94119e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.97 
 
 
292 aa  407  1e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  68.18 
 
 
294 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  68.84 
 
 
290 aa  399  1e-110  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1556  succinate-CoA ligase (ADP-forming), alpha subunit  67.83 
 
 
294 aa  400  1e-110  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  69.07 
 
 
300 aa  391  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.24479e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  6.1731e-07  unclonable  1.52569e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.38 
 
 
300 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
300 aa  388  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  3.16664e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
300 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.26587e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.4 
 
 
290 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.82 
 
 
290 aa  385  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
290 aa  384  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.44 
 
 
291 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.44 
 
 
291 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0956  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  66.55 
 
 
290 aa  384  1e-106  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
300 aa  384  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.53221e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0810  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.83 
 
 
288 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.674167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.38 
 
 
289 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.78 
 
 
290 aa  381  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.38 
 
 
289 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.29 
 
 
299 aa  381  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.64 
 
 
308 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.38 
 
 
289 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.04 
 
 
289 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.86 
 
 
290 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0156  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.98 
 
 
290 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.852217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3485  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  65.98 
 
 
290 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.622532  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.38 
 
 
289 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.59 
 
 
290 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  68.17 
 
 
290 aa  381  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.59 
 
 
290 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1933  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.82 
 
 
290 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  67.82 
 
 
290 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1221  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.94 
 
 
290 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1989  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.45 
 
 
295 aa  379  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  379  1e-104  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1229  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.7 
 
 
289 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.24 
 
 
290 aa  380  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.35 
 
 
290 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.6 
 
 
308 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.13 
 
 
290 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3874  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  68.88 
 
 
293 aa  380  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4348  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.32 
 
 
291 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.265556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.13 
 
 
290 aa  375  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3163  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.01 
 
 
291 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.608891  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1387  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
290 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.341558  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1453  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  65.19 
 
 
291 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.33077  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1638  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0190398  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  67.36 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2965  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
290 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0755  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0741  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2878  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.55 
 
 
290 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0303591  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  377  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0437  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.55 
 
 
315 aa  376  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.188217 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2405  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.97 
 
 
300 aa  374  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.861166  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1041  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.92 
 
 
290 aa  374  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.201704 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00688  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.67 
 
 
289 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.76 
 
 
291 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2068  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.6 
 
 
296 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000768235  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4185  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
294 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2260  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.6 
 
 
291 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.237246  hitchhiker  2.31889e-08 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.27 
 
 
293 aa  374  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2203  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  66.44 
 
 
293 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3756  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
294 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
295 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.55 
 
 
290 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.55 
 
 
290 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  5.98296e-05  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  67.6 
 
 
290 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.9 
 
 
290 aa  373  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  63.67 
 
 
291 aa  372  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
293 aa  371  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143561  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.13 
 
 
302 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3508  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
294 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214073  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3222  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.92 
 
 
290 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.13 
 
 
302 aa  371  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3685  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.13 
 
 
295 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  66.55 
 
 
290 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1669  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  66.78 
 
 
294 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43940  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  67.13 
 
 
295 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  64.71 
 
 
291 aa  372  1e-102  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>