More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0587 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0587  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 98 aa  187  4e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0674011  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0859  chaperonin Cpn10  66.32 
 
 		 96 aa  134  6.0000000000000005e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000206391  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  65.62 
 
 		 96 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0120  chaperonin Cpn10  70.53 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0427234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0020  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.436916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0706  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3714  co-chaperonin GroES  62.89 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3734  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 97 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619596  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3593  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 97 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3660  co-chaperonin GroES  63.92 
 
 		 97 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  67.74 
 
 		 98 aa  123  9e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  61.7 
 
 		 95 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0742  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0723  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 96 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  65.59 
 
 		 98 aa  122  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  63.16 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  60.42 
 
 		 96 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  65.96 
 
 		 97 aa  121  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  62.11 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  68.09 
 
 		 94 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  63.16 
 
 		 95 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5254  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 105 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.321205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2610  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  55.79 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000523216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4543  10 kDa chaperonin (Cpn10), groES  55.79 
 
 		 105 aa  121  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000123576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2346  chaperonin Cpn10  62.11 
 
 		 95 aa  121  4e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00216658  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1705  chaperonin, 10 kDa subunit  61.46 
 
 		 96 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  68.42 
 
 		 94 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3082  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3428  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 105 aa  120  9e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6097  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 96 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6393  chaperonin Cpn10  55.79 
 
 		 105 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.673453  normal  0.108093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0365  co-chaperonin GroES  63.83 
 
 		 96 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000241312  hitchhiker  0.00832872 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0291  Chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0587447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  59.57 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  58.33 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2922  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000127335  n/a   
 
 
 
NC_009379  Pnuc_1806  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 96 aa  117  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265316  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6726  chaperonin Cpn10  52.63 
 
 		 105 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1419  chaperonin Cpn10  57.89 
 
 		 96 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0269029  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  62.37 
 
 		 98 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2340  chaperonin Cpn10  56.84 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.4787  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3687  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  117  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.803225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 98 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1098  chaperonin Cpn10/GroES  57.29 
 
 		 101 aa  117  7e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000000000347589  hitchhiker  0.000183313 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  59.57 
 
 		 95 aa  117  7e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1581  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6250  chaperonin Cpn10  51.58 
 
 		 105 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.646299 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  65.26 
 
 		 95 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4489  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0381842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0146  10 kDa chaperonin GroS  63.44 
 
 		 106 aa  115  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 95 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3425  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3429  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000999948  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2771  10 Kd chaperone GroES  58.51 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  8.05146e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3391  chaperonin, 10 kDa  51.58 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.974932  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  61.7 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2031  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.133549  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 95 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1360  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0209303  normal  0.159546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 104 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0967  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.387654  normal  0.774499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4364  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 97 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.760414  normal  0.0428794 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 98 aa  115  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13470  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  62.37 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  60.22 
 
 		 95 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 96 aa  114  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  58.33 
 
 		 104 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  62.77 
 
 		 97 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  65.59 
 
 		 94 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0883  Bvg accessory factor  61.46 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000200777  hitchhiker  0.000120487 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  58.95 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  57.89 
 
 		 98 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4377  chaperonin, 10 kDa  61.46 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1119  chaperonin Cpn10  56.25 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4073  co-chaperonin GroES  61.46 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  64.52 
 
 		 94 aa  114  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  60.64 
 
 		 98 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  54.17 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  114  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0619  chaperonin Cpn10  60 
 
 		 96 aa  114  6e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4957  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.433731  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57020  co-chaperonin GroES  62.5 
 
 		 97 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  57.45 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0449  chaperonin Cpn10  63.83 
 
 		 95 aa  113  6.9999999999999995e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00196884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1132  co-chaperonin GroES  55.21 
 
 		 96 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000135765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  60 
 
 		 104 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>