174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1247 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1247  primosomal protein DnaI  100 
 
 		 306 aa  638    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1741  primosomal protein DnaI  83.01 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.500286  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1775  primosomal protein DnaI  83.01 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2663  primosomal protein DnaI  42.48 
 
 		 312 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.150188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3264  primosomal protein DnaI  41.31 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0423883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4709  primosomal protein DnaI  41.18 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0140063  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4474  primosomal protein DnaI  41.18 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4822  primosomal protein DnaI  41.18 
 
 		 312 aa  240  2e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4309  primosomal protein DnaI  40.85 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0309734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4320  primosomal protein DnaI  40.85 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4693  primosomal protein DnaI  40.85 
 
 		 312 aa  238  9e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.23235e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0550  primosomal protein DnaI  40.52 
 
 		 312 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000173374  unclonable  3.70822e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4703  primosomal protein DnaI  40.52 
 
 		 312 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000143247  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4409  primosomal protein DnaI  40.52 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0232524  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4688  primosomal protein DnaI  40.2 
 
 		 312 aa  235  7e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000410016  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0795  primosomal protein DnaI  38.85 
 
 		 313 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1242  replicative DNA helicase loader DnaI  38.41 
 
 		 313 aa  202  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000118645  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1416  primosomal protein DnaI  31.16 
 
 		 299 aa  163  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0273394  hitchhiker  0.000000000000115155 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0531  replicative DNA helicase loader DnaI  30.57 
 
 		 315 aa  157  1e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.296741  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0358  primosomal protein DnaI  36.02 
 
 		 300 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0796  primosomal protein DnaI  30.94 
 
 		 293 aa  149  7e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0122  primosomal protein DnaI  36.14 
 
 		 337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0444634  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1621  primosomal protein DnaI  29.66 
 
 		 300 aa  142  7e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0678  replicative DNA helicase loader DnaI  29.93 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0633  hypothetical protein  35.8 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0700177  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl579  chromosomal replication initiator protein  26.46 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  33.1 
 
 		 275 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  27.75 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  27.18 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  27.37 
 
 		 263 aa  72.8  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  25.91 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1802  hypothetical protein  26.29 
 
 		 275 aa  70.9  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  33.05 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  27.63 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  28.93 
 
 		 270 aa  69.7  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  24.31 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  24.11 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  24.11 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  24.11 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  24.11 
 
 		 267 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  28.38 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  30.77 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  27.64 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  27.78 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  25 
 
 		 283 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23130  AAA ATPase  23.71 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  26.27 
 
 		 261 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  24.63 
 
 		 426 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  25.85 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  24.63 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  29.52 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0311  hypothetical protein  26.17 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  24.85 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6259  IstB-like ATP-binding protein  28.95 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  24.28 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0538  Chromosomal replication initiator DnaA  27.66 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4137  IstB ATP binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 246 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1794  putative transposase-related ATP-binding subunit  28.57 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.537102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  24.38 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  27.34 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0998  IstB ATP binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2290  IstB ATP binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4797  IstB ATP binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 249 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2981  IstB ATP binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 251 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0623611  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4228  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0192  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0411  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0597  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1629  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1853  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.262764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2255  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.152335  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2397  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0127781  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3179  IstB ATP binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 251 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  27.48 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  27.48 
 
 		 440 aa  52.4  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00183  transposase  32.05 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01936  hypothetical protein  32.05 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06056  hypothetical protein  32.05 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06962  hypothetical protein  32.05 
 
 		 246 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02341  hypothetical protein  32.05 
 
 		 539 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4731  IstB ATP binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6207  IstB ATP binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5782  IstB ATP binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5629  IstB ATP binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 249 aa  50.4  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0558  IstB ATP binding domain-containing protein  32.95 
 
 		 246 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0637  IstB domain protein ATP-binding protein  25.69 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0831  DNA replication protein-like protein  28.79 
 
 		 272 aa  49.7  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2347  DNA replication protein DnaC  27.59 
 
 		 327 aa  49.7  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.104478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1803  DNA replication protein-like protein  26.67 
 
 		 306 aa  49.3  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.810263  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2467  hypothetical protein  26.53 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  22 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  22 
 
 		 259 aa  49.3  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0785  IstB domain protein ATP-binding protein  24.16 
 
 		 264 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.910617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1327  IstB ATP binding domain-containing protein  26.44 
 
 		 246 aa  49.3  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  29.59 
 
 		 440 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2413  transposase, degenerate  23.17 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1810  IstB ATP binding domain-containing protein  32.1 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2044  IstB domain protein ATP-binding protein  23.17 
 
 		 220 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.307112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6441  IstB domain protein ATP-binding protein  26.32 
 
 		 262 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000708764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>