122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0142 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0142  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 513 aa  1006    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0526  polysaccharide biosynthesis protein  61.57 
 
 		 508 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0539  polysaccharide biosynthesis protein  61.57 
 
 		 508 aa  610  1e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.41345  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0050  polysaccharide biosynthesis protein  32.64 
 
 		 529 aa  229  9e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0050  polysaccharide biosynthesis protein  33.2 
 
 		 533 aa  219  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  32.63 
 
 		 533 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0053  stage V sporulation protein B, putative  32.18 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0064  polysaccharide synthase family protein  33.33 
 
 		 533 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  32.05 
 
 		 533 aa  213  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0054  stage V sporulation protein B  31.61 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0054  stage V sporulation protein B  31.61 
 
 		 533 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  31.42 
 
 		 533 aa  211  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0050  integral membrane protein; stage V sporulation protein B  32 
 
 		 533 aa  210  5e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0061  polysaccharide synthase family protein  34.18 
 
 		 533 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0052  polysaccharide biosynthesis protein  30.9 
 
 		 526 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0050  polysaccharide biosynthesis protein  30 
 
 		 516 aa  186  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0712  polysaccharide biosynthesis protein  28.15 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1062  polysaccharide synthase family protein  29.17 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000239702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0972  polysaccharide synthase family protein  29.33 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0956622 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0839  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  29.33 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0883  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  29.33 
 
 		 506 aa  134  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0971  polysaccharide biosynthesis protein CsaA  29.37 
 
 		 506 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.931032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0787  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 506 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496201  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0785  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 506 aa  128  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  28.34 
 
 		 519 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  27.77 
 
 		 506 aa  120  6e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  27.77 
 
 		 506 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3270  polysaccharide synthase family protein  26.94 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2039  polysaccharide synthase family protein  26.71 
 
 		 459 aa  115  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2118  polysaccharide biosynthesis family protein  27.17 
 
 		 459 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1855  export protein for polysaccharides and teichoic acids  27.17 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.383858  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2150  polysaccharide synthase family protein  27.17 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.230641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2081  polysaccharide synthase family protein  27.17 
 
 		 459 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1902  polysaccharide biosynthesis family protein  26.94 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0218585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1865  export protein for polysaccharides and teichoic acids  26.94 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00212516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2049  polysaccharide biosynthesis family protein  26.94 
 
 		 459 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.686608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1899  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 459 aa  113  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00909179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1538  polysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 		 459 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0542726  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2760  polysaccharide biosynthesis protein  24.41 
 
 		 542 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.874111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4849  polysaccharide biosynthesis family protein  24.52 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0081  stage V sporulation protein B  25.69 
 
 		 517 aa  106  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4603  polysaccharide biosynthesis family protein  24.35 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0339143  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4439  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.35 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4457  polysaccharide biosynthesis family protein; export protein for polysaccharides and teichoic acids  24.35 
 
 		 550 aa  105  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0642469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4959  polysaccharide biosynthesis family protein  24.35 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4824  polysaccharide synthase family protein  24.35 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1700  polysaccharide biosynthesis family protein  23.79 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.312469  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1834  polysaccharide biosynthesis family protein  23.79 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1656  polysaccharide biosynthesis protein; spore cortex protein  23.7 
 
 		 544 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.177668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4842  polysaccharide synthase family protein  24.14 
 
 		 550 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00735996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4819  polysaccharide synthase family protein  23.92 
 
 		 550 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0294842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0417  polysaccharide synthase family protein  24.14 
 
 		 550 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00377185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21180  polysaccharide biosynthesis protein  24.82 
 
 		 539 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.275763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1878  polysaccharide synthase family protein  23.01 
 
 		 544 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013771 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4538  polysaccharide biosynthesis protein  24.16 
 
 		 550 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1681  polysaccharide biosynthesis family protein  23.52 
 
 		 544 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.960771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3370  polysaccharide biosynthesis protein  24.22 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0247135  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1957  polysaccharide synthase family protein  23.01 
 
 		 544 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.55468  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1922  polysaccharide biosynthesis family protein  22.82 
 
 		 544 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1439  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.30396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0673  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 541 aa  94  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1694  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 		 544 aa  94  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196134  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0117  polysaccharide biosynthesis protein  21.89 
 
 		 564 aa  88.6  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2607  virulence factor MVIN family protein  24.12 
 
 		 544 aa  88.2  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.490581  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2804  stage V sporulation protein B  23.7 
 
 		 510 aa  87  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2515  stage V sporulation protein B  24.07 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0654527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0009  polysaccharide biosynthesis protein  24.13 
 
 		 526 aa  84  0.000000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2490  stage V sporulation protein B  24.9 
 
 		 510 aa  83.6  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0388  polysaccharide transporter  26.72 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.379787  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3129  sporulation stage V protein B  25 
 
 		 517 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1293  polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.619814  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1794  polysaccharide biosynthesis protein  23.98 
 
 		 535 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000923307  normal  0.17508 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0460  polysaccharide transporter  22.96 
 
 		 552 aa  79.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000146874  normal  0.345583 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4532  stage V sporulation protein B  28.89 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.53486  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2104  stage V sporulation protein B  21.84 
 
 		 529 aa  78.6  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4498  stage V sporulation protein B  27.62 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4146  stage V sporulation protein B  27.3 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4157  stage V sporulation protein B  27.3 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1809  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1844  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 553 aa  77.4  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4547  stage V sporulation protein B  27.62 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0149138  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4493  stage V sporulation protein B  27.3 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000054659 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4308  stage V sporulation protein B  26.98 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4643  stage V sporulation protein B  26.98 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0703  stage V sporulation protein B  27.39 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0339125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1338  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 		 514 aa  75.9  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00179971  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1313  polysaccharide biosynthesis protein  23.09 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.221909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4260  sporulation stage V protein B  27.71 
 
 		 519 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.976414  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2974  stage V sporulation protein B  24.02 
 
 		 512 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3064  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000038595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2908  polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 509 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000392741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22040  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 		 517 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2328  polysaccharide biosynthesis protein  23.27 
 
 		 534 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0636  polysaccharide transporter  20.86 
 
 		 647 aa  67  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.217916  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0493  polysaccharide transporter  23.36 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0846  polysaccharide transporter  23.21 
 
 		 554 aa  65.5  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.151438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1230  polysaccharide biosynthesis protein  22.35 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0449934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1366  stage V sporulation protein B  21.21 
 
 		 516 aa  63.9  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0345658 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2939  stage V sporulation protein B  21.56 
 
 		 522 aa  63.5  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000274011  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1900  stage V sporulation protein B  20 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000710979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>