270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0129 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0129  50S ribosomal protein L28  100 
 
 		 62 aa  127  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000311049  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1936  50S ribosomal protein L28  95.16 
 
 		 62 aa  122  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000140829  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0198  50S ribosomal protein L28  73.44 
 
 		 64 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000840181  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1308  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00516129  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1283  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  91.3  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000317964  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0790  50S ribosomal protein L28  69.35 
 
 		 62 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1962  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 61 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1072  50S ribosomal protein L28  72.58 
 
 		 61 aa  89.4  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.851187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3900  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000717977  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3599  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.4416900000000005e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3617  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000996715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3957  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000128459  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3681  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000422349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3872  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.02177e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3906  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1286  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000599007  hitchhiker  0.0000083771 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3709  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896689  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3996  50S ribosomal protein L28  70.97 
 
 		 62 aa  87  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000359454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2510  50S ribosomal protein L28  69.35 
 
 		 62 aa  85.1  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000427235  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0768  50S ribosomal protein L28  72.73 
 
 		 61 aa  84.3  5e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000091282  hitchhiker  0.0000000104587 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1165  50S ribosomal protein L28  64.52 
 
 		 61 aa  80.1  0.000000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000103471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0863  ribosomal protein L28  50.82 
 
 		 62 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  normal  0.761868 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1506  50S ribosomal protein L28  55.22 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0291725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0920  50S ribosomal protein L28P  47.37 
 
 		 62 aa  62.4  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000106918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0627  50S ribosomal protein L28  49.18 
 
 		 63 aa  62  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00471545  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3839  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 63 aa  61.6  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.14599e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1410  ribosomal protein L28  55 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1978  ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1163  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1368  50S ribosomal protein L28P  48.39 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266666  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2056  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000851837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1343  LSU ribosomal protein L28P  43.55 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.754318  normal  0.305293 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0446  50S ribosomal protein L28  52.24 
 
 		 66 aa  57  0.00000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000127981  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0670  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000425645  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0757  50S ribosomal protein L28  47.54 
 
 		 62 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.744153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0861  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.582934  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1289  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.61707e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1883  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1987  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1705  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09970  LSU ribosomal protein L28P  42.62 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  hitchhiker  0.00000165787 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2089  50S ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0729886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2750  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1027  50S ribosomal protein L28  50 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.807018  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2433  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102764  normal  0.494456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2326  50S ribosomal protein L28  48.44 
 
 		 97 aa  52.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.972077  normal  0.129991 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0072  ribosomal protein L28  40.35 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0514573  hitchhiker  0.000000000000135012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3586  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.18615 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4154  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000466012  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05560  LSU ribosomal protein L28P  45.16 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0160  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.233197  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3959  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0699911  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3074  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0062  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1088  50S ribosomal protein L28  41.94 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0368802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0056  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000196759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1329  ribosomal protein L28  45.9 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2234  50S ribosomal protein L28  44.26 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000532075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2515  50S ribosomal protein L28  45.16 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246839 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0648  50S ribosomal protein L28P  50 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4841  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000224524  hitchhiker  0.0000339357 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3879  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0687874 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4389  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00781562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4099  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0864217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2556  50S ribosomal protein L28  48.28 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10080  ribosomal protein L28  36.49 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.81205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6556  ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 79 aa  50.8  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1489  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 64 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4041  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0179  ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0500  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.146333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3704  ribosomal protein L28  38.98 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0201  50S ribosomal protein L28  46.55 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0475  50S ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.373803  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1452  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.843962 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1734  50S ribosomal protein L28  45.61 
 
 		 77 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.111139  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0971  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 63 aa  50.4  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1029  50S ribosomal protein L28  45.76 
 
 		 64 aa  50.1  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.605821  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1608  ribosomal protein L28  47.46 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1602  50S ribosomal protein L28  47.37 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf005  ribosomal protein L28  57.45 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3287  50S ribosomal protein L28P  42.62 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0886721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3158  50S ribosomal protein L28  39.34 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000034404  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3927  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0253871  hitchhiker  0.00124431 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4054  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4008  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2733  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3945  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00834113  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4115  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0258863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00654  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0817  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2870  50S ribosomal protein L28  43.86 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0696096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001820  LSU ribosomal protein L28p  42.11 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000491703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1054  50S ribosomal protein L28  36.07 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000960448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3209  50S ribosomal protein L28  36.07 
 
 		 63 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000252463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0074  50S ribosomal protein L28  42.11 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000990162  hitchhiker  0.000000134659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2016  50S ribosomal protein L28  39.66 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42169  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0918  50S ribosomal protein L28  43.1 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904068  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03446  hypothetical protein  42.11 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00212142  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0671  50S ribosomal protein L28  44.83 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0158059  normal  0.225806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>