More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2688 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  100 
 
 
378 aa  715  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  64.09 
 
 
386 aa  409  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  59.04 
 
 
404 aa  399  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.91 
 
 
387 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  54.11 
 
 
387 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  53.55 
 
 
393 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  55.73 
 
 
379 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  57.91 
 
 
376 aa  373  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  56.88 
 
 
382 aa  366  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  54.35 
 
 
379 aa  358  1e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  48.13 
 
 
376 aa  345  8e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  53.89 
 
 
391 aa  336  4e-91  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  50.14 
 
 
376 aa  336  5e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  46.75 
 
 
389 aa  326  4e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  49.87 
 
 
393 aa  320  2e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  39.79 
 
 
352 aa  198  1e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  39.38 
 
 
358 aa  183  4e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.4 
 
 
383 aa  182  7e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  33.88 
 
 
396 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  33.88 
 
 
396 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  33.61 
 
 
396 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  44.38 
 
 
348 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  29.89 
 
 
385 aa  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.42 
 
 
382 aa  166  7e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  33.43 
 
 
390 aa  165  1e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  33.88 
 
 
392 aa  164  2e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  34.56 
 
 
390 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  32.23 
 
 
394 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.16 
 
 
392 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.97 
 
 
395 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  32.79 
 
 
396 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5371  chromate ion transporter  29.64 
 
 
393 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  33.77 
 
 
390 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  33.77 
 
 
390 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  33.33 
 
 
392 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  31.08 
 
 
453 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  30.7 
 
 
393 aa  159  8e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  34.68 
 
 
430 aa  157  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  31.02 
 
 
397 aa  156  6e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  33.15 
 
 
399 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  34.74 
 
 
403 aa  155  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0588  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.26 
 
 
407 aa  154  3e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263065  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  33.53 
 
 
388 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  4.03685e-05 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.5 
 
 
390 aa  153  6e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4615  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.25 
 
 
408 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3539  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.25 
 
 
408 aa  152  8e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0092  chromate transporter  33.14 
 
 
412 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  31.78 
 
 
398 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.72 
 
 
390 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0890  chromate transporter  29.53 
 
 
402 aa  149  5e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  32.11 
 
 
397 aa  149  9e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5326  chromate ion transporter  30.59 
 
 
393 aa  148  2e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  31.35 
 
 
393 aa  148  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.31811e-11 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  31.82 
 
 
401 aa  147  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  33.51 
 
 
401 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5439  chromate ion transporter  30.38 
 
 
393 aa  147  4e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.27 
 
 
441 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5054  chromate ion transporter  30.13 
 
 
393 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  28.01 
 
 
456 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5295  chromate ion transporter  29.12 
 
 
393 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01188e-09 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4999  chromate transporter  30.81 
 
 
393 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4045  chromate transporter  33.04 
 
 
405 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2241  chromate transporter  33.99 
 
 
401 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.132853  hitchhiker  0.00439089 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4884  chromate ion transporter  29.38 
 
 
393 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5316  chromate ion transporter  29.12 
 
 
393 aa  143  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  32.93 
 
 
425 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1699  chromate transporter  32.34 
 
 
392 aa  142  9e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  33.33 
 
 
401 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  33.33 
 
 
401 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  33.33 
 
 
401 aa  142  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  32.15 
 
 
428 aa  142  1e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  33.43 
 
 
403 aa  142  1e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  28.57 
 
 
456 aa  141  2e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  30.11 
 
 
401 aa  141  2e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0933  chromate transporter  33.6 
 
 
401 aa  140  4e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.268399  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2178  chromate transporter  31.69 
 
 
415 aa  140  5e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177453  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  32.17 
 
 
408 aa  139  9e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4899  chromate ion transporter  29.87 
 
 
393 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  30.83 
 
 
401 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1088  chromate transport protein  33.07 
 
 
401 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127725  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0580  chromate resistance protein-related protein  32.78 
 
 
378 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0600435 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  31.89 
 
 
407 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  31.89 
 
 
407 aa  137  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  29.67 
 
 
450 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6309  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.99 
 
 
405 aa  135  1e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  32.99 
 
 
413 aa  135  1e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  34.1 
 
 
418 aa  135  1e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3159  chromate transporter  28.87 
 
 
450 aa  135  1e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896141  normal  0.125861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  32.71 
 
 
447 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.84 
 
 
400 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  31.83 
 
 
388 aa  132  8e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  25.24 
 
 
420 aa  132  9e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  28.61 
 
 
455 aa  132  1e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2542  chromate transporter  31.04 
 
 
403 aa  132  1e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00835827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0746  chromate transport protein  32.72 
 
 
403 aa  131  2e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  30.63 
 
 
346 aa  131  2e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  26.41 
 
 
483 aa  131  2e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  31.76 
 
 
456 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  31.3 
 
 
443 aa  130  4e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2172  chromate transporter  33.63 
 
 
398 aa  129  6e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal  0.873685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>