30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1598 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1598  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1047    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1258  hypothetical protein  52.21 
 
 		 650 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0023  hypothetical protein  45.52 
 
 		 576 aa  325  2e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.640701  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0796  hypothetical protein  40.8 
 
 		 535 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1015  hypothetical protein  44.72 
 
 		 701 aa  276  7e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.693082  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1539  hypothetical protein  44.79 
 
 		 399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2704  bifunctional DNA primase/polymerase  42.94 
 
 		 746 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000315845  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  38 
 
 		 739 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2087  AAA ATPase  44.47 
 
 		 685 aa  254  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1612  hypothetical protein  34.57 
 
 		 866 aa  248  3e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15742  normal  0.514221 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1348  hypothetical protein  41.71 
 
 		 643 aa  245  9.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1199  putative ATP-binding protein  36.87 
 
 		 545 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0498844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2066  hypothetical protein  35.98 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4450  putative ATP-binding protein  37.1 
 
 		 427 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.403742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  34.89 
 
 		 880 aa  205  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4830  putative ATP-binding protein  37.36 
 
 		 525 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4916  putative ATP-binding protein  39.16 
 
 		 377 aa  189  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.325325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1122  HMG-I and HMG-Y, DNA-binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 572 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.371922  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3378  hypothetical protein  36.64 
 
 		 317 aa  160  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0412  hypothetical protein  45.98 
 
 		 911 aa  78.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.778681  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1371  hypothetical protein  45.57 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0370  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1058 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0956297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2033  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1033 aa  68.6  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923118  normal  0.210395 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1396  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1080 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.146503 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2956  hypothetical protein  37.66 
 
 		 1062 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2652  hypothetical protein  36.56 
 
 		 123 aa  63.2  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1090  hypothetical protein  34.78 
 
 		 1072 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.539931  normal  0.249716 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1383  hypothetical protein  33.04 
 
 		 1047 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.161884  normal  0.438502 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1882  hypothetical protein  37.35 
 
 		 1058 aa  60.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1027 aa  50.1  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000509076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>