56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0144 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  47.92 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  50 
 
 
113 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0969  hypothetical protein  42 
 
 
109 aa  87  7e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  32.67 
 
 
113 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  36.63 
 
 
113 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  31.96 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1671  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3673  hypothetical protein  33.66 
 
 
113 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12005  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  30.59 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  37.97 
 
 
114 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  29 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  53.9  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  32.32 
 
 
102 aa  53.5  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  30.3 
 
 
102 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  30.59 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  34.15 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  34.15 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  31.52 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  29.41 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  29.7 
 
 
116 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  27.06 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  30.69 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  28.28 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  32.65 
 
 
110 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  27.45 
 
 
114 aa  50.8  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  31.37 
 
 
122 aa  50.1  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  29.7 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  28 
 
 
115 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  30 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  32.26 
 
 
102 aa  47.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  29.03 
 
 
133 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  25.26 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  24.49 
 
 
126 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  25.25 
 
 
118 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  27.06 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  27.06 
 
 
88 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  30.49 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  27.59 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  27.59 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  25.24 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  25.24 
 
 
105 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  25.24 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  29.41 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  29.59 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  29.29 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  24.51 
 
 
105 aa  40.8  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  25.96 
 
 
111 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>