25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3821 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3821  putative transmembrane anti-sigma factor  100 
 
 		 255 aa  491  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563425 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3094  putative transmembrane anti-sigma factor  98.82 
 
 		 255 aa  484  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.334579  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3672  hypothetical protein  89.41 
 
 		 255 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.671386 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6012  putative transmembrane anti-sigma factor  46.88 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.784619  normal  0.0731526 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7160  putative transmembrane anti-sigma factor  45.91 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.494902  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6219  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0474635  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4483  putative transmembrane anti-sigma factor  40 
 
 		 259 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.662421  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4551  putative transmembrane anti-sigma factor  40.62 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.902003  decreased coverage  0.00125777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1369  putative transmembrane anti-sigma factor  44.12 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1649  putative transmembrane anti-sigma factor  41.1 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0261743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3927  putative transmembrane anti-sigma factor  40.47 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1375  hypothetical protein  45.27 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018937 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3973  putative transmembrane anti-sigma factor  37.86 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323006  normal  0.293955 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0059  putative transmembrane anti-sigma factor  28.41 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.13724  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0012  putative transmembrane anti-sigma factor  28.41 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.237975  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2661  putative transmembrane anti-sigma factor  37.93 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260623  normal  0.584947 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0264  putative transmembrane anti-sigma factor  37.93 
 
 		 266 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.674824  normal  0.0227624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0853  putative transmembrane anti-sigma factor  46.77 
 
 		 274 aa  51.6  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0033  putative transmembrane anti-sigma factor  28.04 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00163217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3198  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  29.52 
 
 		 252 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000206133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5734  putative transmembrane anti-sigma factor  54.1 
 
 		 266 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3142  transmembrane protein  34.78 
 
 		 277 aa  47  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5401  putative transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  42.19 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3793  hypothetical protein  37.25 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0670841  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1672  transmembrane transcriptional regulator (anti-sigma factor)  38 
 
 		 275 aa  42  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>