More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3574 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  87.18 
 
 
390 aa  653  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
390 aa  754  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  97.69 
 
 
390 aa  681  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  88.83 
 
 
401 aa  631  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  88.25 
 
 
401 aa  633  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  88.31 
 
 
401 aa  622  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  83.33 
 
 
390 aa  611  1e-174  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  83.33 
 
 
390 aa  611  1e-174  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  79.02 
 
 
397 aa  607  1e-172  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  83.08 
 
 
390 aa  607  1e-172  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  77.32 
 
 
392 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  76.8 
 
 
392 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  77.23 
 
 
394 aa  575  1e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  75.51 
 
 
396 aa  564  1e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  74.3 
 
 
396 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  74.3 
 
 
396 aa  558  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  74.05 
 
 
396 aa  556  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  67.45 
 
 
385 aa  502  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  69.63 
 
 
398 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  70.47 
 
 
400 aa  481  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  68.81 
 
 
399 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  63.49 
 
 
393 aa  470  1e-131  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  66.31 
 
 
382 aa  453  1e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  61.08 
 
 
395 aa  447  1e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  58.1 
 
 
392 aa  419  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1212  chromate transport protein  75.68 
 
 
188 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1495  chromate transport protein  75.68 
 
 
188 aa  286  5e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  76.34 
 
 
187 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  76.34 
 
 
187 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.23 
 
 
383 aa  196  4e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  36.15 
 
 
379 aa  183  4e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  35.36 
 
 
382 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.24 
 
 
393 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.38 
 
 
404 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  34.34 
 
 
389 aa  174  2e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  30.63 
 
 
393 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.71 
 
 
387 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.89 
 
 
387 aa  171  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  30.41 
 
 
442 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.72 
 
 
386 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.35911e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2467  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.95 
 
 
391 aa  169  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.21 
 
 
376 aa  165  1e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2247  chromate transporter  30.56 
 
 
453 aa  165  1e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0538278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  34.84 
 
 
388 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  29.3 
 
 
376 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0285  chromate transporter  28.93 
 
 
446 aa  156  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5759  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.21 
 
 
457 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  32.9 
 
 
379 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0450  chromate transporter  29.44 
 
 
456 aa  154  3e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0081  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.38 
 
 
450 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.826612 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2144  chromate transporter  29.74 
 
 
447 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4365  chromate transporter  28.07 
 
 
455 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.6524  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  30.68 
 
 
376 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2526  CHR transporter  29.37 
 
 
445 aa  148  2e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  26.88 
 
 
420 aa  148  2e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3555  chromate transporter  27.3 
 
 
454 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4886  chromate transporter  30.07 
 
 
456 aa  147  4e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  29.51 
 
 
454 aa  144  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  34.17 
 
 
378 aa  144  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  30.48 
 
 
443 aa  141  2e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  27.81 
 
 
428 aa  140  3e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  1.19825e-05 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  30.84 
 
 
428 aa  140  5e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0316  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.09 
 
 
447 aa  140  5e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  27.55 
 
 
463 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.92 
 
 
395 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3067  chromate transporter  30.39 
 
 
452 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0932406  normal  0.975583 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12381  chromate transporter  27.67 
 
 
408 aa  132  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  25.06 
 
 
416 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0723  chromate transporter  26.54 
 
 
408 aa  130  4e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  28.95 
 
 
466 aa  129  9e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  31.55 
 
 
417 aa  128  2e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  28.69 
 
 
463 aa  127  2e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6097  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.5 
 
 
469 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2679  chromate transporter  28.06 
 
 
443 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.36 
 
 
469 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1753  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.56 
 
 
467 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1475  chromate transporter  27.08 
 
 
467 aa  122  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.215191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0153  chromate transporter  26.16 
 
 
466 aa  122  1e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.193683  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  27.67 
 
 
469 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.58 
 
 
469 aa  121  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2389  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.49 
 
 
473 aa  120  5e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.443126  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.19 
 
 
441 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.42 
 
 
441 aa  119  1e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.43 
 
 
352 aa  118  2e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0139  chromate transporter  28.12 
 
 
462 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2724  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.06 
 
 
473 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.506221  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2523  chromate transporter  25.11 
 
 
471 aa  116  7e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4194  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.29 
 
 
469 aa  116  7e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  28.91 
 
 
460 aa  116  8e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  27.46 
 
 
449 aa  115  1e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2556  chromate transporter  27.97 
 
 
450 aa  115  1e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2804  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.54 
 
 
470 aa  115  1e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  34.94 
 
 
398 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0120  chromate transporter  31.83 
 
 
387 aa  114  3e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.320143  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  30.4 
 
 
358 aa  113  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1633  chromate transporter  26.18 
 
 
432 aa  113  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4327  chromate transporter  37.75 
 
 
444 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.685407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2237  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  27.61 
 
 
468 aa  110  4e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.09 
 
 
386 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  26.84 
 
 
397 aa  108  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>