More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0641 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2550  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.6 
 
 
464 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3083  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.53 
 
 
472 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.835798  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0691  putative phosphomannomutase or phosphoglucomutase protein  93.91 
 
 
461 aa  892    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0002556  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2191  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.31 
 
 
472 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.738295  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0745  phosphomannomutase  80.22 
 
 
461 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1092  phosphomannomutase  71.96 
 
 
461 aa  704    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.329341  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3143  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.6 
 
 
464 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0641  Phosphomannomutase  100 
 
 
462 aa  947    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1489  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.82 
 
 
464 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0374748  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2064  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.6 
 
 
464 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.020226  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3701  phosphomannomutase  68.9 
 
 
464 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.994541 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2716  phosphomannomutase  81.74 
 
 
461 aa  793    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0541607  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2267  phosphomannomutase  68.9 
 
 
464 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434508  normal  0.220531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0781  Phosphomannomutase  72.61 
 
 
461 aa  717    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0600  Phosphomannomutase  97.19 
 
 
462 aa  926    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106733  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0920  Phosphomannomutase  68.03 
 
 
464 aa  674    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3119  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.53 
 
 
472 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14281  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2497  phosphomannomutase  66.88 
 
 
485 aa  653    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.679752  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  67.31 
 
 
961 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0863  phosphomannomutase  67.17 
 
 
464 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3990  phosphomannomutase  67.39 
 
 
464 aa  633  1e-180  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.047705 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0414  phosphomannomutase  67.1 
 
 
489 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0893  phosphomannomutase  67.1 
 
 
489 aa  634  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0783  phosphomannomutase  66.95 
 
 
464 aa  628  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0772  phosphomannomutase  66.67 
 
 
487 aa  629  1e-179  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2138  phosphomannomutase  64.78 
 
 
457 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1062  phosphomannomutase  62.91 
 
 
469 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3299  phosphomannomutase  63.42 
 
 
458 aa  605  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230097 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1921  phosphomannomutase  64.18 
 
 
457 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2141  phosphomannomutase  62.99 
 
 
463 aa  591  1e-168  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3964  phosphomannomutase  62.26 
 
 
462 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.234927 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1206  Phosphomannomutase  62.17 
 
 
465 aa  578  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3725  Phosphomannomutase  61.44 
 
 
460 aa  580  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1108  phosphomannomutase  60.39 
 
 
460 aa  575  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.813588  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1639  phosphomannomutase  59.57 
 
 
461 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.306168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1830  Phosphomannomutase  60.52 
 
 
462 aa  564  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.325101  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2021  phosphomannomutase  60.09 
 
 
462 aa  563  1.0000000000000001e-159  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155894  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2822  phosphomannomutase  60.4 
 
 
486 aa  557  1e-157  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2994  phosphomannomutase  57.17 
 
 
468 aa  545  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2999  phosphomannomutase  58.53 
 
 
475 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2443  phosphomannomutase  57.51 
 
 
472 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.299376 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5288  phosphomannomutase  56.3 
 
 
463 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5197  phosphomannomutase  56.3 
 
 
466 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.335843 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2782  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  57.63 
 
 
463 aa  535  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5338  phosphomannomutase  55.87 
 
 
466 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00384224 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0183  phosphomannomutase  55.67 
 
 
465 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.12891  decreased coverage  0.0000000447524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2559  phosphomannomutase  58.23 
 
 
460 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.344329  normal  0.0761518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0083  phosphomannomutase AlgC  55.58 
 
 
465 aa  525  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4379  phosphomannomutase  55.31 
 
 
863 aa  525  1e-148  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.124617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6098  phosphomannomutase AlgC  54.35 
 
 
868 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.21229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0219  phosphomannomutase  54.88 
 
 
465 aa  522  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5542  phosphomannomutase  54.45 
 
 
465 aa  523  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02910  Phosphomannomutase/phosphoglucomutase AlgC  54.43 
 
 
488 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70270  phosphomannomutase AlgC  54.35 
 
 
854 aa  523  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1905  phosphomannomutase  54.62 
 
 
461 aa  518  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.293066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2845  phosphomannomutase  55.39 
 
 
469 aa  514  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301586  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2983  phosphomannomutase  53.33 
 
 
467 aa  502  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.794325  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3561  phosphomannomutase  52.72 
 
 
881 aa  503  1e-141  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1786  phosphoglucomutase  52.84 
 
 
471 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0399  phosphomannomutase  53.48 
 
 
471 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.889065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02922  phosphomannomutase  52.88 
 
 
782 aa  491  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.919523  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2297  phosphomannomutase  52.7 
 
 
464 aa  481  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0286  Phosphomannomutase  53.67 
 
 
782 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.132974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2550  phosphomannomutase  45.77 
 
 
462 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2406  phosphomannomutase  45.99 
 
 
462 aa  425  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3676  phosphomannomutase  46.09 
 
 
830 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.991755  normal  0.132768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1175  phosphomannomutase  42.99 
 
 
447 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0160  phosphomannomutase  45.23 
 
 
456 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0178  Phosphomannomutase  45.23 
 
 
456 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0167  phosphomannomutase  45.23 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0166  phosphomannomutase  43.83 
 
 
456 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.120075 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0332  phosphomannomutase  43.88 
 
 
469 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2278  phosphomannomutase  46.4 
 
 
453 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.984443  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1398  phosphomannomutase  45.58 
 
 
458 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  41.86 
 
 
450 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2945  phosphomannomutase  43.02 
 
 
457 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2154  phosphomannomutase  43.24 
 
 
449 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2673  Phosphomannomutase  42.98 
 
 
464 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00943387 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0113  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.14 
 
 
847 aa  378  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0128  phosphomannomutase  44.14 
 
 
495 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.142416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2238  phosphomannomutase  41.46 
 
 
455 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.119559  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1021  phosphomannomutase  44.49 
 
 
472 aa  363  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0485  Phosphomannomutase  43.05 
 
 
466 aa  363  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3001  phosphomannomutase  42.63 
 
 
460 aa  363  4e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.324631  normal  0.16456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2791  phosphomannomutase  43.57 
 
 
460 aa  362  8e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.677839 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1915  phosphomannomutase  43.71 
 
 
453 aa  362  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0122  Phosphomannomutase  43.72 
 
 
469 aa  358  9e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0067  Phosphomannomutase  39.79 
 
 
475 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0362  Phosphomannomutase  40.77 
 
 
474 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1242  Phosphomannomutase  41.91 
 
 
469 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1993  Phosphomannomutase  43.86 
 
 
459 aa  351  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229621 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0468  Phosphomannomutase  41.19 
 
 
462 aa  349  7e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.489238  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3316  phosphomannomutase  41.48 
 
 
467 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2652  phosphomannomutase  42.21 
 
 
469 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0045  phosphomannomutase  42.4 
 
 
467 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.109324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2720  phosphomannomutase  42.21 
 
 
468 aa  340  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5049  Phosphomannomutase  40.83 
 
 
479 aa  329  6e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.477893 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0623  phosphomannomutase  38.29 
 
 
452 aa  319  7e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1799  Phosphomannomutase  38.04 
 
 
456 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0306  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  35.67 
 
 
455 aa  296  6e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0317157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>