122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3288 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3610  NnrS family protein  98.76 
 
 		 404 aa  754    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.84805  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3288  NnrS family protein  100 
 
 		 404 aa  768    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.451558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3399  hypothetical protein  75.74 
 
 		 403 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5307  putative heme/copper membrane protein  60.25 
 
 		 401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0853882  normal  0.0678899 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2398  hypothetical protein  50.88 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2891  hypothetical protein  50.88 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00927369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1711  hypothetical protein  50.88 
 
 		 398 aa  296  4e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.129457  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0614  hypothetical protein  50.88 
 
 		 406 aa  296  5e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2701  heme/copper membrane protein  51.63 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2821  Heme/copper membrane protein  51.63 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2759  hypothetical protein  51.13 
 
 		 398 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1798  hypothetical protein  49.62 
 
 		 406 aa  278  1e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.425687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2607  NnrS family protein  45.5 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4999  NnrS  50.13 
 
 		 405 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.441301  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2847  NnrS family protein  45.16 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2336  NnrS family protein  44.91 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00114269  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1884  NnrS  44.12 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0526931  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3970  NnrS family protein  44.53 
 
 		 398 aa  241  2e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693479 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2741  hypothetical protein  45.81 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.300362  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0630  hypothetical protein  45.81 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446034  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2807  Heme/copper membrane protein  44.95 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.817552  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2382  hypothetical protein  45.81 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.863987  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2905  hypothetical protein  45.81 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2683  hypothetical protein  45.81 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1810  hypothetical protein  45.62 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.427105  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1475  NnrS family protein  45.74 
 
 		 399 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0760953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4727  NnrS  43.67 
 
 		 398 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03874  Heme/copper membrane protein  37.98 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2876  NnrS family protein  32.84 
 
 		 406 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.534905  hitchhiker  0.00000000207371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2322  NnrS family protein  35.41 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000140024  normal  0.965133 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1409  hypothetical protein  42.61 
 
 		 424 aa  200  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.922088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1410  NnrS-like protein  36.62 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.124987  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03317  hypothetical protein  34.31 
 
 		 406 aa  189  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3037  NnrS family protein  32.44 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0630  Heme/copper membrane protein of NnrS family protein  34.15 
 
 		 394 aa  186  5e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1910  hypothetical protein  35.12 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0720  putative heme-Cu membrane protein (NnrS)  32.38 
 
 		 393 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0687  NnrS family protein  31.78 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0504  NnrS family protein  33.57 
 
 		 403 aa  181  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2159  NnrS family protein  46.91 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0400909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2362  NnrS family protein  32.03 
 
 		 403 aa  179  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000703097  decreased coverage  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0227  NnrS family protein  40.41 
 
 		 390 aa  177  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2805  hypothetical protein  33.66 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2587  NnrS family protein  33.17 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16699  normal  0.0601628 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002671  NnrS protein  34.64 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1680  NnrS family protein  32.92 
 
 		 390 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1227  NnrS family protein  31.88 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25611  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2677  NnrS family protein  32.92 
 
 		 390 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0244063 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2849  NnrS family protein  35.64 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1665  NnrS family protein  32.92 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410131  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3603  NnrS family protein  34.47 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.147714  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1288  hypothetical protein  33.98 
 
 		 389 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0467877  normal  0.017488 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2901  NnrS family protein  32.78 
 
 		 414 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.81186  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6821  putative membrane protein, NnrS-like protein  37.08 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0686  NnrS family protein  31.66 
 
 		 431 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2560  NnrS family protein  35.04 
 
 		 397 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12013  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4283  hypothetical protein  33.92 
 
 		 401 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6279  NnrS family protein  38.29 
 
 		 403 aa  161  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  0.20499 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1673  NnrS family protein  33.33 
 
 		 408 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.496066  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3473  NnrS  32.26 
 
 		 422 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1702  NnrS family protein  31.42 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.591488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0259  hypothetical protein  34.34 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0283  hypothetical protein  34.34 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0557  NnrS  34.07 
 
 		 402 aa  157  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.042435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3582  NnrS family protein  37.39 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.936992  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3791  NnrS  34.63 
 
 		 409 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.527545  normal  0.280069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2840  NnrS family protein  35.13 
 
 		 393 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.250907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2837  NnrS  31.55 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0722604  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0765  NnrS family protein  29.2 
 
 		 409 aa  152  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.960663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2168  NnrS  35.55 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1235  NnrS  35.67 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00575591  unclonable  0.0000000301222 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0102  hypothetical protein  35.92 
 
 		 418 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.139814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2105  NnrS family protein  35.91 
 
 		 392 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0196977  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3145  NnrS family protein  31.84 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0163982  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5672  NnrS family protein  36.86 
 
 		 392 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2940  NnrS family protein  34.18 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0648  NnrS  33.25 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.86713  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4275  NnrS  35.95 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3182  NnrS family protein  34.95 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827588  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0849  putative ATP synthase F0, A subunit  28.17 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0307  NnrS family protein  31.38 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.799454  normal  0.0277833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0967  NnrS family protein  36.29 
 
 		 397 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2574  NnrS family protein  39.07 
 
 		 392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00111099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2425  NnrS family protein  32.66 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.194019  normal  0.204544 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2495  NnrS family protein  32.66 
 
 		 390 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.0503888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4037  NnrS  33.83 
 
 		 408 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2181  NnrS  32.03 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2303  hypothetical protein  34.62 
 
 		 432 aa  129  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3859  NnrS family protein  37.28 
 
 		 391 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2322  NnrS family protein  34.64 
 
 		 400 aa  127  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138032  normal  0.897473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29660  hypothetical protein  35.13 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1006  NnrS family protein  36.31 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1348  hypothetical protein  26.88 
 
 		 417 aa  123  5e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4230  NnrS family protein  33.68 
 
 		 404 aa  123  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2537  hypothetical protein  35.49 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1119  NnrS  36.93 
 
 		 396 aa  121  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1524  NnrS family protein  35.29 
 
 		 394 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1973  NnrS family protein  38.46 
 
 		 397 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0328  hypothetical protein  37.66 
 
 		 397 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2874  NnrS  30.61 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>