179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2489 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2489  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  292  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0016498  normal  0.0588103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2368  hypothetical protein  87.23 
 
 		 142 aa  254  3e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.864843  normal  0.24311 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0242  protein of unknown function DUF55  70.99 
 
 		 138 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0087907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0705  hypothetical protein  58.02 
 
 		 133 aa  154  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0061  hypothetical protein  53.62 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.177861  normal  0.0759985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0059  hypothetical protein  52.17 
 
 		 154 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0076  protein of unknown function DUF55  51.45 
 
 		 146 aa  135  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1486  hypothetical protein  47.76 
 
 		 139 aa  133  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0064  protein of unknown function DUF55  50.72 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.956582  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1317  hypothetical protein  48.53 
 
 		 148 aa  130  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559236  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0702  protein of unknown function DUF55  45.99 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.807504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2850  hypothetical protein  47.76 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1261  protein of unknown function DUF55  44.6 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.673781 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0742  protein of unknown function DUF55  45.52 
 
 		 140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.274906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3598  hypothetical protein  49.61 
 
 		 125 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289311  normal  0.0163526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0729  hypothetical protein  45.52 
 
 		 140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.580961 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2937  protein of unknown function DUF55  45.45 
 
 		 138 aa  123  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.362763 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0496  protein of unknown function DUF55  47.54 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.587964  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2115  hypothetical protein  42.22 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3412  protein of unknown function DUF55  44.2 
 
 		 139 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1748  hypothetical protein  44.44 
 
 		 138 aa  120  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2173  hypothetical protein  44.03 
 
 		 137 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1136  protein of unknown function DUF55  44.03 
 
 		 137 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0115295  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0044  hypothetical protein  42.22 
 
 		 137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5451  protein of unknown function DUF55  42.42 
 
 		 137 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.794452 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1041  hypothetical protein  46.15 
 
 		 141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2832  hypothetical protein  40.58 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3573  hypothetical protein  42.11 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.612442  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0559  hypothetical protein  42.96 
 
 		 137 aa  115  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0926  protein of unknown function DUF55  44.03 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3206  hypothetical protein  41.91 
 
 		 141 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.162762  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0170  protein of unknown function DUF55  44.17 
 
 		 131 aa  114  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0060  hypothetical protein  40.44 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0164  hypothetical protein  43.07 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4077  hypothetical protein  41.48 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.225729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0291  hypothetical protein  41.48 
 
 		 137 aa  113  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.852842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0468  hypothetical protein  42.96 
 
 		 137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0724  hypothetical protein  37.12 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.142066  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1512  hypothetical protein  43.28 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3218  hypothetical protein  40.91 
 
 		 144 aa  112  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2917  hypothetical protein  40.74 
 
 		 137 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0673011  normal  0.0896051 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0082  hypothetical protein  40.91 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1331  hypothetical protein  39.42 
 
 		 147 aa  110  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00023234  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2001  hypothetical protein  41.04 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0254  protein of unknown function DUF55  40 
 
 		 137 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.049773  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2222  protein of unknown function DUF55  40.91 
 
 		 147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.155182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0472  hypothetical protein  37.78 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.904612  normal  0.134048 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3129  ubiquinol-cytochrome c reductase, iron-sulfur subunit  42.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1217  protein of unknown function DUF55  41.54 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.02485  hitchhiker  0.000132613 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2363  hypothetical protein  40.26 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1108  hypothetical protein  39.55 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3446  hypothetical protein  43.71 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0271189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2275  hypothetical protein  39.74 
 
 		 163 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1891  hypothetical protein  37.68 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1819  hypothetical protein  37.68 
 
 		 142 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0710947  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0317  hypothetical protein  36.3 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1853  protein of unknown function DUF55  37.16 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.890211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2196  hypothetical protein  37.16 
 
 		 150 aa  102  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4141  hypothetical protein  40.58 
 
 		 143 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0971  hypothetical protein  37.41 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1341  hypothetical protein  35.04 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414601 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0926  hypothetical protein  35.11 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1357  hypothetical protein  37.66 
 
 		 155 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000263938  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1154  hypothetical protein  37.4 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.306462  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2962  hypothetical protein  39.13 
 
 		 143 aa  98.6  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.481941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4016  protein of unknown function DUF55  38.69 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.450546 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02383  hypothetical protein  39.61 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3695  protein of unknown function DUF55  37.23 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2026  hypothetical protein  39.47 
 
 		 189 aa  92.4  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.661768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0266  protein of unknown function DUF55  37.75 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.252089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0319  hypothetical protein  36.99 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0251  protein of unknown function DUF55  40.13 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000275849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1312  hypothetical protein  41.18 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.29751e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2318  protein of unknown function DUF55  39.1 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0509  hypothetical protein  35.57 
 
 		 152 aa  90.1  8e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000393887  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1642  hypothetical protein  35.57 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  7.18563e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3212  hypothetical protein  38.41 
 
 		 156 aa  87.4  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2738  protein of unknown function DUF55  34.21 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.10704  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1573  hypothetical protein  37.09 
 
 		 156 aa  87  8e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000165437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0697  protein of unknown function DUF55  34.87 
 
 		 155 aa  87  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3142  hypothetical protein  36.73 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1180  hypothetical protein  39.44 
 
 		 154 aa  86.7  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6859  protein of unknown function DUF55  33.55 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0506026 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2948  hypothetical protein  30.87 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2907  hypothetical protein  31.97 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5440  hypothetical protein  34.93 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0037  hypothetical protein  34.23 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5266  hypothetical protein  35.76 
 
 		 153 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.561565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2537  hypothetical protein  36 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.954602  normal  0.0651387 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2135  protein of unknown function DUF55  38.1 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.204502 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5229  hypothetical protein  34.25 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2983  protein of unknown function DUF55  34.9 
 
 		 155 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.394198 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0315  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2287  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2359  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000352986  normal  0.137051 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0961  hypothetical protein  34.87 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23359  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0953  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69050  hypothetical protein  34.69 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0651  hypothetical protein  35.42 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2792  hypothetical protein  35.62 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.495937 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>