More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1646 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1646  chaperone DnaJ domain-containing protein  100 
 
 
289 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.452129  normal  0.810021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2836  chaperone DnaJ domain-containing protein  89.51 
 
 
287 aa  481  1e-135  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.151954  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0146  chaperone DnaJ domain protein  60.28 
 
 
287 aa  358  8e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0029  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  50.76 
 
 
334 aa  320  9.999999999999999e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000766624  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2296  chaperone DnaJ domain protein  54.57 
 
 
331 aa  296  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3610  chaperone DnaJ domain protein  48.4 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.266514  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3094  chaperone DnaJ domain-containing protein  47 
 
 
324 aa  265  8.999999999999999e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2940  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.71 
 
 
315 aa  263  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  hitchhiker  0.00256478 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5708  chaperone DnaJ domain protein  41.1 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.219179 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1218  chaperone DnaJ domain-containing protein  46.32 
 
 
330 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0453172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2533  chaperone DnaJ domain protein  42.31 
 
 
307 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0815946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1676  chaperone DnaJ domain protein  42.38 
 
 
299 aa  242  6e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.338376  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2005  chaperone DnaJ domain protein  42.68 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0103714  normal  0.200196 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1192  molecular chaperone, DnaJ family  46.01 
 
 
330 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.159001  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1223  curved DNA-binding protein  42.62 
 
 
341 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.362557  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1271  curved DNA-binding protein  42.62 
 
 
313 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2674  chaperone DnaJ domain protein  41.08 
 
 
309 aa  231  7.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0134  heat shock protein DnaJ-like  42.07 
 
 
335 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2345  putative DnaJ chaperone protein  41.88 
 
 
315 aa  224  9e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0544  chaperone DnaJ domain protein  44.44 
 
 
291 aa  224  9e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1411  DnaJ family protein  46.01 
 
 
330 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0580  chaperone DnaJ domain protein  40.44 
 
 
324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1789  heat shock protein DnaJ-like  40.95 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0101299 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2960  heat shock protein DnaJ domain protein  41.16 
 
 
340 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00431414  normal  0.488513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02190  Chaperone protein CbpA  40.85 
 
 
313 aa  218  8.999999999999998e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1000  heat shock protein DnaJ domain protein  39.42 
 
 
314 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1288  chaperone DnaJ domain-containing protein  43.65 
 
 
316 aa  216  4e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479526  normal  0.450004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3803  heat shock protein DnaJ  39.93 
 
 
293 aa  215  7e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.185873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1727  curved DNA-binding protein  47.56 
 
 
308 aa  215  8e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.360233  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4618  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.24 
 
 
325 aa  214  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2022  heat shock protein DnaJ-like  39.75 
 
 
333 aa  214  9.999999999999999e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.190531  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  36.9 
 
 
375 aa  214  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1659  heat shock protein DnaJ-like  43.41 
 
 
315 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0499725  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0453  chaperone DnaJ domain-containing protein  41.32 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1039  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  39.1 
 
 
315 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2078  chaperone DnaJ-like protein  42.68 
 
 
302 aa  212  4.9999999999999996e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0261  chaperone DnaJ domain-containing protein  44.16 
 
 
324 aa  212  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0719528  normal  0.782454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2406  dnaJ domain-containing protein  43.09 
 
 
313 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0006  chaperone protein DnaJ  38.84 
 
 
382 aa  211  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.359061  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  36.71 
 
 
382 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
382 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  37.29 
 
 
382 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01003  curved DNA-binding protein, DnaJ-like protein that functions as a co-chaperone of DnaK  40.47 
 
 
306 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2642  chaperone DnaJ domain protein  40.47 
 
 
306 aa  209  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0789  chaperone protein DnaJ  38.64 
 
 
377 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01010  hypothetical protein  40.47 
 
 
306 aa  209  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0330  chaperone protein DnaJ  39.03 
 
 
379 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1112  curved DNA-binding protein CbpA  40.47 
 
 
306 aa  209  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2124  curved DNA-binding protein CbpA  40.47 
 
 
306 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.584386  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2595  curved DNA-binding protein CbpA  40.47 
 
 
306 aa  209  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0519  chaperone DnaJ domain protein  42.81 
 
 
298 aa  209  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0693  chaperone protein DnaJ  37.89 
 
 
375 aa  209  5e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580174  decreased coverage  0.000845971 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6271  chaperone protein DnaJ  36.89 
 
 
387 aa  209  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2303  chaperone protein DnaJ  38.46 
 
 
384 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0682598  normal  0.202059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1118  curved DNA-binding protein CbpA  40.13 
 
 
306 aa  207  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1236  curved DNA-binding protein CbpA  40.13 
 
 
306 aa  207  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.152819  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00015  chaperone Hsp40, co-chaperone with DnaK  36.75 
 
 
376 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.229266  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3593  chaperone protein DnaJ  35.57 
 
 
379 aa  206  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00197721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0014  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.503295  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00015  hypothetical protein  36.75 
 
 
376 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.35027  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1207  curved DNA-binding protein CbpA  39.67 
 
 
306 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.358657 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1176  curved DNA-binding protein CbpA  39.67 
 
 
306 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.668416  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3465  chaperone protein DnaJ  35.57 
 
 
379 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000171425  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1071  curved DNA-binding protein CbpA  39.67 
 
 
306 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0796  chaperone protein DnaJ  35.57 
 
 
379 aa  206  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000075688  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0352  chaperone protein DnaJ  37.39 
 
 
379 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0014  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0014  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.65684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0018  chaperone protein DnaJ  36.75 
 
 
376 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.129066  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0013  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.29167  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1187  curved DNA-binding protein CbpA  39.67 
 
 
306 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.227747  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0014  chaperone protein DnaJ  36.03 
 
 
379 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1346  DnaJ-like molecular chaperone  38.72 
 
 
299 aa  207  2e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1222  curved DNA-binding protein CbpA  39.67 
 
 
306 aa  207  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.898218 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0013  chaperone protein DnaJ  36.75 
 
 
376 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0016  chaperone protein DnaJ  36.75 
 
 
376 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3236  heat shock protein DnaJ domain protein  39.75 
 
 
320 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3641  chaperone protein DnaJ  36.75 
 
 
376 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0015  chaperone protein DnaJ  36.75 
 
 
376 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.292346  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2621  chaperone DnaJ domain-containing protein  40.14 
 
 
283 aa  206  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.591487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0543  chaperone protein DnaJ  36.54 
 
 
377 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0680  chaperone protein DnaJ  37.61 
 
 
374 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2065  heat shock protein DnaJ, N-terminal:chaperone DnaJ, C-terminal  40.52 
 
 
315 aa  205  5e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3550  heat shock protein DnaJ-like  43.67 
 
 
298 aa  206  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00109126  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0192  chaperone protein DnaJ  37.5 
 
 
375 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2171  heat shock protein DnaJ-like  40.54 
 
 
335 aa  205  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.239332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  36.13 
 
 
378 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2314  curved DNA-binding protein CbpA  39.8 
 
 
306 aa  205  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  36.13 
 
 
378 aa  205  6e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3582  chaperone protein DnaJ  36.47 
 
 
376 aa  205  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0015  chaperone protein DnaJ  36.47 
 
 
376 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5061  chaperone DnaJ domain protein  41.12 
 
 
303 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00177728  hitchhiker  0.00778785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0200  chaperone DnaJ domain protein  41.75 
 
 
297 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000536584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1291  chaperone DnaJ-like  43.99 
 
 
318 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0635621  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0430  chaperone protein DnaJ  37.89 
 
 
379 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0535  chaperone protein DnaJ  34.75 
 
 
379 aa  204  1e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4397  heat shock protein DnaJ-like  36.25 
 
 
337 aa  204  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1327  chaperone protein DnaJ  36.72 
 
 
381 aa  204  1e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.869234  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2816  chaperone DnaJ domain protein  39.46 
 
 
335 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  38.38 
 
 
382 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>