More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1802 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_1802  sulfatase  100 
 
 
518 aa  1067  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.389525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2053  sulfatase  65.26 
 
 
523 aa  703  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000240603 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0214  sulfatase  49.53 
 
 
536 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1574  sulfatase  49.24 
 
 
554 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1568  sulfatase  45 
 
 
549 aa  450  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.423465  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2113  sulfatase  44.47 
 
 
572 aa  446  1e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.367046  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2242  sulfatase  34.13 
 
 
512 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2519  sulfatase  30.69 
 
 
507 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.602817  normal  0.0521471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1836  sulfatase  31.13 
 
 
514 aa  212  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0122  sulfatase protein  29.45 
 
 
508 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3858  sulfatase  29.06 
 
 
519 aa  198  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0969664  normal  0.154261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4186  sulfatase  28.8 
 
 
519 aa  196  8e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.360689  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1173  sulfatase  28.63 
 
 
458 aa  196  9e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3064  arylsulfatase A  29.17 
 
 
494 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.886966  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3166  sulfatase  29.86 
 
 
482 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6647  sulfatase  28.98 
 
 
476 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.707956 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3655  sulfatase  26.14 
 
 
526 aa  159  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0999851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1300  arylsulfatase  30.4 
 
 
486 aa  153  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0569  sulfatase  29.31 
 
 
497 aa  151  4e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0911  choline-sulfatase  29.18 
 
 
509 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  9.29958e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0177  sulfatase  29.34 
 
 
505 aa  150  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06030  arylsulfatase A family protein  27.97 
 
 
496 aa  148  2e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2100  sulfatase  25.34 
 
 
480 aa  148  2e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0151  sulfatase  26.6 
 
 
473 aa  147  4e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.110259  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0304  sulfatase  31.43 
 
 
497 aa  147  4e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.567268  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0221  arylsulfatase  26.65 
 
 
481 aa  145  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0847512  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5075  choline-sulfatase  29.18 
 
 
512 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  hitchhiker  0.0038506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2368  putative N-acetylglucosamine-6-sulfatase  25 
 
 
537 aa  144  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1966  choline sulfatase  31.19 
 
 
522 aa  143  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0841  sulfatase family protein  31.19 
 
 
522 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2121  choline sulfatase  31.19 
 
 
522 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0697  choline sulfatase  31.19 
 
 
522 aa  143  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.286425  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0993  choline sulfatase  31.19 
 
 
522 aa  143  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37476  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0484  choline sulfatase  31.02 
 
 
517 aa  142  1e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1855  choline sulfatase  30.83 
 
 
517 aa  142  2e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.250441  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0651  sulfatase  26.87 
 
 
535 aa  141  2e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1716  sulfatase  27.18 
 
 
508 aa  141  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0753  sulfatase family protein  30.98 
 
 
517 aa  141  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1985  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1005  sulfatase  29.24 
 
 
518 aa  140  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.549789  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3323  sulfatase  28.85 
 
 
502 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5009  choline-sulfatase  29.49 
 
 
516 aa  138  3e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1573  putative choline-sulfatase  28.39 
 
 
515 aa  138  3e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5110  sulfatase  27.56 
 
 
497 aa  137  6e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.36096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4186  sulfatase  27.87 
 
 
497 aa  137  6e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03505  hypothetical protein  27.56 
 
 
497 aa  136  7e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.973058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03562  predicted sulfatase/phosphatase  27.56 
 
 
497 aa  136  7e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.678565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0025  sulfatase  27.56 
 
 
497 aa  136  7e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0029  sulfatase  27.38 
 
 
501 aa  135  2e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3146  sulfatase  28.72 
 
 
489 aa  135  2e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4484  sulfatase  29.71 
 
 
511 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3570  choline-sulfatase  30.06 
 
 
511 aa  134  5e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0165  sulfatase family protein  27.18 
 
 
501 aa  133  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1775  sulfatase  26.69 
 
 
587 aa  131  2e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.819016  normal  0.42216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00380  choline sulfatase  28.25 
 
 
503 aa  130  5e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.103488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3290  choline-sulfatase  28.77 
 
 
513 aa  129  9e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3296  sulfatase  29.15 
 
 
516 aa  129  9e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.787928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0026  sulfatase  27.4 
 
 
510 aa  129  9e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.407954  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5072  sulfatase  29.15 
 
 
516 aa  129  9e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263154  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1494  sulfatase  27.38 
 
 
502 aa  129  1e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000530638  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1529  sulfatase  26.92 
 
 
499 aa  129  1e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.856317  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4043  sulfatase  27.27 
 
 
497 aa  129  1e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0032  choline sulfatase  28.19 
 
 
503 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6693  choline-sulfatase  26.97 
 
 
502 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17144  normal  0.223575 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3133  sulfatase  28.71 
 
 
504 aa  126  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2250  sulfatase  28.74 
 
 
478 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0594  putative choline sulfatase  27.47 
 
 
501 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0888  sulfatase  25.67 
 
 
517 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  1.91984e-05  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05449  conserved hypothetical protein similar to choline sulphatase (Eurofung)  29.39 
 
 
594 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0257615  normal  0.340962 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2247  sulfatase  27.27 
 
 
501 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.466267 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3492  sulfatase  26.35 
 
 
498 aa  125  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3268  sulfatase  27.29 
 
 
495 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0376086  normal  0.666848 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0064  sulfatase  27.62 
 
 
502 aa  123  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22600  choline-sulfatase  26.71 
 
 
520 aa  123  9e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124418  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0496  sulfatase  28.88 
 
 
501 aa  122  1e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.261478  normal  0.387641 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5790  choline-sulfatase  27.57 
 
 
504 aa  123  1e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0271234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04770  arylsulfatase A family protein  28.32 
 
 
478 aa  121  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.799262  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1150  choline sulfatase  28.08 
 
 
496 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0077  choline sulfatase  28.22 
 
 
505 aa  121  4e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.604146  hitchhiker  0.000459968 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2286  sulfatase  28.4 
 
 
498 aa  120  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.220131 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0096  choline-sulfatase  27.55 
 
 
505 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.574472  hitchhiker  9.26567e-05 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0093  sulfatase  27.81 
 
 
505 aa  119  1e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0564  sulfatase  27.81 
 
 
512 aa  119  2e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0093  choline-sulfatase  27.29 
 
 
505 aa  118  2e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.95462e-10 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0126  sulfatase  24.03 
 
 
467 aa  118  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1530  sulfatase  26.76 
 
 
586 aa  117  4e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2068  sulfatase  26.12 
 
 
491 aa  116  1e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00300653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1432  sulfatase  23.58 
 
 
522 aa  116  1e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.209793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5764  sulfatase  32.86 
 
 
482 aa  116  1e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2553  sulfatase  25.14 
 
 
520 aa  114  5e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0891  sulfatase  26.54 
 
 
565 aa  113  7e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2621  sulfatase  24.67 
 
 
512 aa  112  1e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0161574  normal  0.118013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1580  sulfatase  26.48 
 
 
459 aa  112  2e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37197  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1700  sulfatase  26.75 
 
 
479 aa  111  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0968821  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2247  sulfatase  26.81 
 
 
493 aa  111  4e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2358  sulfatase family protein  24.1 
 
 
499 aa  110  5e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.303331  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2095  sulfatase  23.21 
 
 
594 aa  110  8e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0637  sulfatase  26.98 
 
 
457 aa  110  8e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3441  sulfatase  25.91 
 
 
511 aa  110  8e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0813077  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0357  sulfatase  23.62 
 
 
491 aa  110  8e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3903  sulfatase  25.34 
 
 
486 aa  110  9e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>