46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0649 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  76.06 
 
 		 472 aa  728    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  100 
 
 		 470 aa  954    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  67.11 
 
 		 499 aa  597  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  51.75 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  51.08 
 
 		 460 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  52.8 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  52.8 
 
 		 460 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  53.85 
 
 		 466 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  52.8 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  53.61 
 
 		 466 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  51.53 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  51.53 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  51.54 
 
 		 466 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  46.62 
 
 		 441 aa  375  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  45 
 
 		 452 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  41.02 
 
 		 480 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  38.29 
 
 		 469 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  40.87 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  38.59 
 
 		 468 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  35.24 
 
 		 453 aa  296  7e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  36.77 
 
 		 434 aa  289  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  36.62 
 
 		 458 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  36.63 
 
 		 440 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  38.11 
 
 		 438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  36.62 
 
 		 459 aa  283  4.0000000000000003e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  37.14 
 
 		 432 aa  279  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  35.86 
 
 		 432 aa  277  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  36.7 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  36.39 
 
 		 435 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  35.67 
 
 		 519 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  38.44 
 
 		 427 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  35.49 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  35.49 
 
 		 436 aa  260  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  34.62 
 
 		 536 aa  259  8e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  34.47 
 
 		 578 aa  258  2e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  32.86 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  33.18 
 
 		 538 aa  250  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  33.81 
 
 		 436 aa  249  6e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  32.72 
 
 		 538 aa  249  8e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  33.18 
 
 		 538 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  34.38 
 
 		 435 aa  245  9.999999999999999e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  33.57 
 
 		 437 aa  242  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0862  ATPase  44.23 
 
 		 743 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.445688  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3433  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 234 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04190  vesicular-fusion protein sec18, putative  21.97 
 
 		 844 aa  43.9  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3754  ATPase  36.07 
 
 		 805 aa  43.5  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>