299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0019 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0019  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0050  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000158922  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0027  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.257176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0046  tRNA-Asp  93.44 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0027  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000174629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0026  tRNA-Gly  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.223483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0019  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000618512  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0009  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000723102  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt52  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.894326 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0033  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.228268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0026  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0083  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00487262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0024  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000390894  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0034  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt13  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  87.88 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0045  tRNA-Gly  88.57 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.102714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0046  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000127996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0053  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000895644  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0064  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000325658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0012  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0572972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0043  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27027  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0028  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763177  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0022  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0021  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.713807  normal  0.0150575 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0007  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000198503  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0002  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.14234  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0028  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4573  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.110089 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0060  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.481193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0216  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000219569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0612  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000121451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0031  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0005  tRNA-Gly  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281079  normal  0.0361726 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0051  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.128011  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0056  tRNA-Ala  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0135  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000405897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0071  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00174778  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4765  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000105314  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0018  tRNA-Gly  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0783  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.7717399999999996e-31 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0098  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00020662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>