22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4251 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4251  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  345  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.35457 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3925  hypothetical protein  82.66 
 
 
173 aa  293  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.297382 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4382  hypothetical protein  49.13 
 
 
174 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3199  hypothetical protein  50.62 
 
 
181 aa  143  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1096  hypothetical protein  36.93 
 
 
193 aa  89.7  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1739  putative lipoprotein  34.1 
 
 
193 aa  84.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1806  hypothetical protein  34.1 
 
 
193 aa  84.7  5e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0105  hypothetical protein  29.94 
 
 
178 aa  70.5  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3210  hypothetical protein  32.68 
 
 
178 aa  67  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0285  hypothetical protein  30.06 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4097  hypothetical protein  31.25 
 
 
181 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.54765  normal  0.0129619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0224  hypothetical protein  30.59 
 
 
179 aa  57  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.335655  normal  0.0429524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1447  hypothetical protein  29.88 
 
 
205 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0337  hypothetical protein  29.25 
 
 
179 aa  52.8  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0131786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1588  hypothetical protein  27.81 
 
 
184 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0287437 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1867  hypothetical protein  27.81 
 
 
188 aa  52  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0170  hypothetical protein  24.84 
 
 
183 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1651  hypothetical protein  26 
 
 
188 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.638182  normal  0.600332 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0099  hypothetical protein  26.11 
 
 
194 aa  44.3  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.485401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0291  hypothetical protein  25.42 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0935679  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0386  hypothetical protein  25 
 
 
186 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.256767  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0435  hypothetical protein  25.42 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>