39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2162 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  88.33 
 
 		 677 aa  1171    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 		 679 aa  1339    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1518  hypothetical protein  52.5 
 
 		 666 aa  592  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  33.6 
 
 		 638 aa  133  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  32.76 
 
 		 638 aa  127  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3726  membrane protein-like  31.28 
 
 		 671 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4642  membrane protein-like protein  31.28 
 
 		 671 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5662  hypothetical protein  31.91 
 
 		 671 aa  93.6  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4189  hypothetical protein  30.41 
 
 		 487 aa  74.7  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.154141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  28.29 
 
 		 733 aa  69.3  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  21.43 
 
 		 740 aa  66.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1351  hypothetical protein  26.32 
 
 		 721 aa  57  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003309  hypothetical protein  24.12 
 
 		 451 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.934821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0473  membrane protein-like protein  29.73 
 
 		 764 aa  50.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.695599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  19.73 
 
 		 746 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.99 
 
 		 730 aa  49.7  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  26.45 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  26.45 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6076  membrane protein  34.85 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  26.45 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0005  hypothetical protein  32.16 
 
 		 377 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00809476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  26.45 
 
 		 758 aa  47.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2509  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.69 
 
 		 746 aa  46.6  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000184796  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  25.81 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.16 
 
 		 763 aa  46.2  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  27.91 
 
 		 725 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  25.81 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  25.81 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  25.16 
 
 		 758 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  29.21 
 
 		 361 aa  45.8  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.16 
 
 		 763 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.16 
 
 		 763 aa  45.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.16 
 
 		 763 aa  45.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.16 
 
 		 764 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5794  integral membrane protein, YccS/YhfK family  23.9 
 
 		 720 aa  45.1  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.16 
 
 		 764 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  25.16 
 
 		 764 aa  45.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  26.53 
 
 		 717 aa  44.7  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.83 
 
 		 806 aa  44.3  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>