36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0037 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0037  UspA domain protein  100 
 
 
163 aa  325  2e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.451642  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0025  UspA domain protein  97.55 
 
 
163 aa  294  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.83625  normal  0.406465 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0035  UspA domain-containing protein  85.89 
 
 
163 aa  285  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329999  hitchhiker  1.51739e-05 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0429  Universal stress protein  87.12 
 
 
163 aa  275  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384598  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4036  hypothetical protein  63.8 
 
 
163 aa  222  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0141  hypothetical protein  63.19 
 
 
162 aa  204  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0154  UspA domain-containing protein  64.42 
 
 
162 aa  188  3e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0135  hypothetical protein  63.58 
 
 
179 aa  184  5e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0216796  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0297  UspA domain-containing protein  54.6 
 
 
168 aa  172  2e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637126  normal  0.0141888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3610  UspA domain-containing protein  56.86 
 
 
168 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0039  hypothetical protein  48.78 
 
 
164 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.389129 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0008  hypothetical protein  46.34 
 
 
164 aa  147  9e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.664621  normal  0.18728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0015  hypothetical protein  48.17 
 
 
164 aa  146  1e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0940017  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0867  hypothetical protein  46.67 
 
 
151 aa  142  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0751448 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4427  UspA domain protein  46.91 
 
 
167 aa  139  1e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0450533  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0460  hypothetical protein  46.95 
 
 
164 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0458  UspA  44.51 
 
 
164 aa  133  1e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0248  hypothetical protein  45.12 
 
 
164 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2278  UspA domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  130  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.574601 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0890  UspA domain-containing protein  40 
 
 
151 aa  131  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.622697  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3395  UspA domain-containing protein  45.68 
 
 
167 aa  130  1e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.251638 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2838  hypothetical protein  42.67 
 
 
151 aa  127  7e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00794322  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3730  hypothetical protein  42.67 
 
 
151 aa  124  8e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.808369 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0584  hypothetical protein  45.45 
 
 
164 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.355702  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0532  UspA domain-containing protein  40.27 
 
 
151 aa  118  3e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.206586  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2215  hypothetical protein  38.81 
 
 
134 aa  114  8e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2501  hypothetical protein  37.5 
 
 
173 aa  109  2e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3027  hypothetical protein  36.08 
 
 
158 aa  108  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3532  hypothetical protein  40.13 
 
 
185 aa  108  4e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.053335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1947  hypothetical protein  31.08 
 
 
152 aa  71.6  5e-12  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.869369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1368  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
151 aa  64.7  5e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131997  normal  0.256671 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1234  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  38 
 
 
151 aa  54.3  7e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  28.46 
 
 
390 aa  42.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  36.11 
 
 
295 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
295 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 
295 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>