More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6477 on replicon NC_011371
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
301 aa  577  1e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  95.35 
 
 
301 aa  558  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6627  hypothetical protein  47.78 
 
 
299 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.725322 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6147  hypothetical protein  47.78 
 
 
299 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5782  hypothetical protein  47.78 
 
 
299 aa  209  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6058  hypothetical protein  47.02 
 
 
298 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  47.54 
 
 
299 aa  200  2e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5832  hypothetical protein  46.08 
 
 
298 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.684234 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  41.58 
 
 
291 aa  193  3e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  40.93 
 
 
314 aa  173  3e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1193  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.76 
 
 
295 aa  170  3e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.503688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  36.5 
 
 
287 aa  169  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0112  hypothetical protein  42.81 
 
 
298 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  37.23 
 
 
287 aa  167  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  35.4 
 
 
287 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  35.27 
 
 
303 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  35.27 
 
 
303 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  4.6973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  35.58 
 
 
304 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  36.26 
 
 
304 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  36.26 
 
 
304 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  35.21 
 
 
304 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  35.58 
 
 
304 aa  147  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  2.55461e-07 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  36.73 
 
 
312 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  34.35 
 
 
304 aa  142  9e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.88959e-05 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1368  hypothetical protein  34.71 
 
 
306 aa  135  6e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.496352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  33.44 
 
 
319 aa  134  2e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  34.97 
 
 
302 aa  130  4e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0391  hypothetical protein  37.26 
 
 
331 aa  128  1e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  35.21 
 
 
304 aa  125  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 
340 aa  124  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  34.29 
 
 
327 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 
335 aa  123  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0207  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.14 
 
 
356 aa  115  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 
294 aa  111  2e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  28.72 
 
 
290 aa  106  6e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.3 
 
 
312 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
342 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  30.28 
 
 
299 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4101  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.02 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518904  normal  0.0241309 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.28 
 
 
304 aa  95.9  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  26.57 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  26.57 
 
 
301 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  26.57 
 
 
301 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  26.57 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  26.2 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  25.91 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  9.31242e-05 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  25.55 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  25.55 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  30.8 
 
 
279 aa  87.4  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  25.55 
 
 
303 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  25.83 
 
 
301 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  25.55 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  25.55 
 
 
303 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  25.55 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  25.18 
 
 
303 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  24.82 
 
 
303 aa  85.1  1e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.08 
 
 
287 aa  85.1  1e-15  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  3.80606e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  28.16 
 
 
296 aa  85.5  1e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  25.18 
 
 
303 aa  84.3  2e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  25.83 
 
 
301 aa  84.3  2e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.99 
 
 
292 aa  84.7  2e-15  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
283 aa  84  3e-15  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  25.83 
 
 
301 aa  84  3e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4598  hypothetical protein  25.83 
 
 
301 aa  83.6  4e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.72 
 
 
312 aa  82.8  6e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  25.9 
 
 
296 aa  81.6  1e-14  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  28.26 
 
 
296 aa  82  1e-14  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 
304 aa  82  1e-14  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.82 
 
 
302 aa  81.6  1e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4486  DMT family permease  27.46 
 
 
304 aa  79.7  5e-14  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  25.34 
 
 
301 aa  78.6  1e-13  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4883  transporter, EamA family  25.56 
 
 
301 aa  78.2  2e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  29.72 
 
 
294 aa  76.6  4e-13  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  30.08 
 
 
316 aa  76.6  4e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  27.53 
 
 
305 aa  76.6  5e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 
317 aa  76.6  5e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.21 
 
 
325 aa  76.3  7e-13  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
306 aa  75.9  7e-13  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.86 
 
 
304 aa  75.5  9e-13  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  28.47 
 
 
308 aa  75.5  1e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 
293 aa  75.5  1e-12  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4318  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
305 aa  74.7  2e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342879 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.47 
 
 
305 aa  74.7  2e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0577458  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  29.12 
 
 
306 aa  73.9  3e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 
305 aa  72.8  6e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
301 aa  72.8  7e-12  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  1.57317e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.78 
 
 
349 aa  72.4  9e-12  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.12 
 
 
330 aa  70.9  2e-11  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  24.91 
 
 
315 aa  71.6  2e-11  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.79 
 
 
296 aa  70.9  3e-11  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 
299 aa  70.1  4e-11  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.63 
 
 
340 aa  70.1  4e-11  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  27.76 
 
 
325 aa  70.1  4e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.88 
 
 
294 aa  70.1  5e-11  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.8 
 
 
296 aa  69.7  6e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  31.4 
 
 
296 aa  69.3  7e-11  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.58 
 
 
296 aa  69.3  7e-11  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.58 
 
 
296 aa  69.3  7e-11  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>