More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0121 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0121  peptidase C26  100 
 
 		 407 aa  809    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.808568 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2450  peptidase C26  71.88 
 
 		 409 aa  560  1e-158  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0651  glutamine amidotransferase class-I  39.74 
 
 		 242 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.64648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  37.93 
 
 		 237 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2010  peptidase C26  37.82 
 
 		 243 aa  132  9e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0361829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1944  Endoribonuclease L-PSP  46.58 
 
 		 153 aa  127  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13709  hypothetical protein  46.94 
 
 		 151 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0525391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6055  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 162 aa  126  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.316335  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1092  endoribonuclease L-PSP  41.84 
 
 		 151 aa  124  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3546  Endoribonuclease L-PSP  45.52 
 
 		 155 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4853  Endoribonuclease L-PSP  44.59 
 
 		 154 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2408  endoribonuclease L-PSP  46.21 
 
 		 155 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.628638  normal  0.167618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3043  endoribonuclease L-PSP  45.52 
 
 		 155 aa  122  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0200  endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 		 153 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.151399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3343  Endoribonuclease L-PSP  40.28 
 
 		 152 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0721684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1504  endoribonuclease L-PSP  48.59 
 
 		 155 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.910903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2027  endoribonuclease L-PSP  38.78 
 
 		 154 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0633724  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1113  Endoribonuclease L-PSP  43.26 
 
 		 155 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85817  normal  0.626067 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0168  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 153 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1645  Endoribonuclease L-PSP  34.72 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.827325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0713  Endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 152 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2448  endoribonuclease L-PSP  44.37 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.514496  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1379  endoribonuclease L-PSP  39.1 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6426  endoribonuclease L-PSP  44.68 
 
 		 153 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.576265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3793  endoribonuclease L-PSP  40.28 
 
 		 154 aa  117  5e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.756407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5691  endoribonuclease L-PSP  42.28 
 
 		 152 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1613  endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 154 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.578745  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2457  endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 		 153 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1740  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 152 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6138  endoribonuclease L-PSP  43.97 
 
 		 153 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2388  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 152 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.921996  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4751  putative endoribonuclease L-PSP (protein synthesis inhibitor)  44.37 
 
 		 155 aa  116  8.999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.708532  normal  0.751414 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2352  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 152 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2270  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 152 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.724419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2319  endoribonuclease L-PSP  46 
 
 		 157 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  40.41 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2373  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 152 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0927  endoribonuclease L-PSP  41.38 
 
 		 152 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.553211 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1636  endoribonuclease L-PSP  42.65 
 
 		 154 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.564581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0841  endoribonuclease L-PSP  44.44 
 
 		 164 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0241  Endoribonuclease L-PSP  48.95 
 
 		 152 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.206377  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  35.35 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2803  endoribonuclease L-PSP  45.07 
 
 		 155 aa  114  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.117143  normal  0.432336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4883  endoribonuclease L-PSP  43.38 
 
 		 157 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000371063  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3105  endoribonuclease L-PSP  45.58 
 
 		 155 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.473778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0950  L-PSP family endoribonuclease  39.6 
 
 		 164 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0094  peptidase C26  37.79 
 
 		 236 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000432288  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5207  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 162 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000695376 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4820  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 162 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4906  endoribonuclease L-PSP  43.75 
 
 		 162 aa  113  6e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.374579 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0581  endoribonuclease L-PSP  36.73 
 
 		 154 aa  113  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0481259  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6842  Endoribonuclease L-PSP  41.5 
 
 		 168 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173433 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0082  peptidase C26  37.44 
 
 		 236 aa  113  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.831872  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1062  Endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 151 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1313  L-PSP family endoribonuclease  37.97 
 
 		 164 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0076  peptidase C26  38.32 
 
 		 236 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1346  endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 152 aa  113  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00288796  normal  0.104373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1212  Endoribonuclease L-PSP  40.94 
 
 		 154 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1577  Endoribonuclease L-PSP  37.16 
 
 		 156 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.401191  normal  0.481334 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3313  endoribonuclease L-PSP  42.38 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2153  endoribonuclease L-PSP, putative  38.46 
 
 		 152 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8908  Endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 152 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.974502 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0708  L-PSP family endoribonuclease  38.56 
 
 		 155 aa  111  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2072  putative endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 152 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.110705  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2223  L-PSP family endoribonuclease  39.46 
 
 		 152 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1162  putative endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 152 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2542  L-PSP family endoribonuclease  39.46 
 
 		 152 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455947  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0332  endoribonuclease L-PSP  45.89 
 
 		 163 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0921694 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1153  putative endoribonuclease L-PSP  39.46 
 
 		 152 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0336  endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 154 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0465  hypothetical protein  46.62 
 
 		 152 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.346493 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1427  endoribonuclease L-PSP  42.07 
 
 		 155 aa  110  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.426351 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4282  endoribonuclease L-PSP  45.95 
 
 		 154 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.667627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3178  Endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 177 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.738101 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4551  Endoribonuclease L-PSP  41.33 
 
 		 157 aa  110  5e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1774  Endoribonuclease L-PSP  37.84 
 
 		 156 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.98491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2118  endoribonuclease L-PSP  41.61 
 
 		 154 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.124484  normal  0.0891562 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1122  hypothetical protein  35.37 
 
 		 154 aa  110  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.457332  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2477  endoribonuclease L-PSP  42.47 
 
 		 153 aa  109  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738257  normal  0.0496442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3144  endoribonuclease L-PSP  37.5 
 
 		 152 aa  109  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_004310  BR1165  hypothetical protein  35.37 
 
 		 154 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2699  Endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 162 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396345  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  32.55 
 
 		 241 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  37.04 
 
 		 233 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5536  endoribonuclease L-PSP  41.26 
 
 		 156 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.044824 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1180  Endoribonuclease L-PSP  41.01 
 
 		 153 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4070  endoribonuclease L-PSP  39.87 
 
 		 162 aa  107  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1204  endoribonuclease L-PSP  38.93 
 
 		 156 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.375276 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2531  hypothetical protein  35.81 
 
 		 156 aa  107  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4437  Endoribonuclease L-PSP  40.67 
 
 		 157 aa  107  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.062411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5125  endoribonuclease L-PSP  40.77 
 
 		 154 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0435  endoribonuclease L-PSP  40.28 
 
 		 155 aa  106  7e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1643  glutamine amidotransferase, class I  33.48 
 
 		 229 aa  106  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0420698  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0932  Endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 152 aa  106  8e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.315119  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2030  Endoribonuclease L-PSP  36.24 
 
 		 156 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00146961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  35.43 
 
 		 231 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0434  Endoribonuclease L-PSP  44.52 
 
 		 155 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.51654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0813  peptidase C26  30.99 
 
 		 264 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.540694  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2736  endoribonuclease L-PSP  44.14 
 
 		 146 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1018  endoribonuclease L-PSP  39.6 
 
 		 152 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.386479  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>