270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3297 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  100 
 
 		 345 aa  706    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  72.89 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  73.39 
 
 		 360 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  72.01 
 
 		 346 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  74.71 
 
 		 350 aa  517  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  72.3 
 
 		 350 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  70.59 
 
 		 375 aa  488  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  65.89 
 
 		 349 aa  462  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  64.72 
 
 		 349 aa  451  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  67.77 
 
 		 357 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  64.33 
 
 		 355 aa  442  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  66.07 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  62.76 
 
 		 345 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  63.8 
 
 		 345 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  63.89 
 
 		 354 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  62.54 
 
 		 345 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  64.2 
 
 		 351 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  60.42 
 
 		 343 aa  421  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  60.67 
 
 		 341 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  60.37 
 
 		 682 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  60.37 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  63.46 
 
 		 341 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  60.37 
 
 		 682 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  62.38 
 
 		 350 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  56 
 
 		 332 aa  396  1e-109  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  62.82 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  60.68 
 
 		 350 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  60.37 
 
 		 341 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  61.16 
 
 		 341 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  61.41 
 
 		 346 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  62.06 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  62.06 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  58.15 
 
 		 318 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  62.06 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  62.06 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  62.06 
 
 		 341 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  62.06 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  58.15 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  58.47 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  57.51 
 
 		 315 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  59.09 
 
 		 315 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  61.74 
 
 		 341 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  57.83 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  57.88 
 
 		 339 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  59.27 
 
 		 334 aa  382  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  58.23 
 
 		 341 aa  381  1e-105  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  58.75 
 
 		 335 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  55.83 
 
 		 335 aa  383  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  57.83 
 
 		 317 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  55.21 
 
 		 339 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  58.06 
 
 		 315 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  58.73 
 
 		 338 aa  380  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  57.83 
 
 		 316 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  57.19 
 
 		 317 aa  378  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  53.73 
 
 		 338 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  59.05 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  57.51 
 
 		 316 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  53.23 
 
 		 335 aa  364  1e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  51.23 
 
 		 328 aa  363  2e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  54.21 
 
 		 347 aa  362  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  54.21 
 
 		 347 aa  362  8e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  51.05 
 
 		 335 aa  361  9e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  53.75 
 
 		 337 aa  361  1e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  56.27 
 
 		 339 aa  360  3e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  50.73 
 
 		 361 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  49.7 
 
 		 336 aa  351  8.999999999999999e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  50.93 
 
 		 335 aa  348  5e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  52.7 
 
 		 336 aa  346  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  52.15 
 
 		 343 aa  345  8e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  52.16 
 
 		 378 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  52.32 
 
 		 353 aa  333  3e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  50 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  48.1 
 
 		 330 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  55.81 
 
 		 328 aa  322  6e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  47.43 
 
 		 338 aa  321  9.999999999999999e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  48.61 
 
 		 341 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  50.31 
 
 		 341 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  46.5 
 
 		 333 aa  296  4e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  45.18 
 
 		 343 aa  295  6e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  45.51 
 
 		 344 aa  293  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  47.54 
 
 		 342 aa  292  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  46.18 
 
 		 337 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  44.48 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  42.86 
 
 		 346 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  44.65 
 
 		 338 aa  285  7e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  43.94 
 
 		 348 aa  278  7e-74  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  43.79 
 
 		 341 aa  258  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  39.64 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0307453 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  37.29 
 
 		 364 aa  245  6.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3177  adenosine deaminase  34.27 
 
 		 346 aa  202  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00286404  normal  0.437767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2430  adenosine deaminase  33.83 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10229  normal  0.205271 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2867  adenosine deaminase  33.33 
 
 		 353 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  36.51 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  34.83 
 
 		 340 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  29.85 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  30.15 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  34.46 
 
 		 337 aa  183  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0045  adenosine deaminase  31.25 
 
 		 354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1766  adenosine deaminase  34.63 
 
 		 340 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.474067  hitchhiker  0.00306919 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5348  adenosine deaminase  38.22 
 
 		 352 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.195409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>