More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2743 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2743  oxidoreductase-like  100 
 
 		 374 aa  759    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.147197  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2321  oxidoreductase domain protein  55.34 
 
 		 357 aa  368  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2249  putative oxidoreductase  52.35 
 
 		 346 aa  345  6e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217263 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2033  putative oxidoreductase  49.58 
 
 		 348 aa  341  9e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2333  putative oxidoreductase  49.58 
 
 		 348 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0848893  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1824  putative oxidoreductase  51.15 
 
 		 346 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0203744 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1812  putative oxidoreductase  49.86 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.984118  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1832  putative oxidoreductase  49.86 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1699  putative oxidoreductase  49.86 
 
 		 359 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.785849  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1995  putative oxidoreductase  49.17 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2265  putative oxidoreductase  49.17 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1881  putative oxidoreductase  49.17 
 
 		 349 aa  332  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01593  predicted oxidoreductase  51.72 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0907965  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2006  putative oxidoreductase  51.72 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00151609  normal  0.380811 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2336  putative oxidoreductase  51.72 
 
 		 346 aa  331  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1257  oxidoreductase domain-containing protein  51.24 
 
 		 348 aa  331  1e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1560  putative oxidoreductase  51.15 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000251187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1632  putative oxidoreductase  51.15 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.418537  normal  0.373499 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1712  putative oxidoreductase  51.15 
 
 		 346 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.418168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2018  oxidoreductase domain protein  51.44 
 
 		 346 aa  329  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1575  putative oxidoreductase  51.15 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.544728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1880  putative oxidoreductase  50.86 
 
 		 346 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1572  putative oxidoreductase  50.86 
 
 		 346 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.45929  normal  0.305998 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1908  putative oxidoreductase  47.63 
 
 		 349 aa  322  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2663  oxidoreductase-like protein  49.44 
 
 		 350 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.015271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2145  putative oxidoreductase  48.03 
 
 		 349 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04302  oxidoreductase YvaA  47.88 
 
 		 350 aa  321  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4267  oxidoreductase domain protein  53.17 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.944939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4377  oxidoreductase domain protein  53.17 
 
 		 358 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0993293 
 
 
-
 
NC_003296  RS02398  oxidoreductase protein  54.22 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.446825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1748  oxidoreductase domain-containing protein  48.06 
 
 		 346 aa  305  9.000000000000001e-82  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3319  oxidoreductase domain-containing protein  48.32 
 
 		 361 aa  295  8e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1765  oxidoreductase domain-containing protein  50 
 
 		 345 aa  295  8e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375729  normal  0.321426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4048  oxidoreductase domain-containing protein  43.7 
 
 		 346 aa  286  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10280  predicted dehydrogenase  48.19 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3704  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.38 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000343929  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3390  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.38 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3655  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.38 
 
 		 343 aa  281  9e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1611  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.09 
 
 		 343 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0635321  hitchhiker  0.0000000369623 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3353  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.09 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0022588  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3606  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  39.09 
 
 		 343 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.28667e-25 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3437  oxidoreductase domain protein  49.01 
 
 		 347 aa  280  3e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0473864 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3302  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  38.24 
 
 		 343 aa  279  6e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3283  oxidoreductase domain-containing protein  39.66 
 
 		 343 aa  279  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3615  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  39.38 
 
 		 343 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000987324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05620  Oxidoreductase, NAD-binding Rossmann fold, GFO_IDH_MocA family  43.02 
 
 		 336 aa  274  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.17984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5886  hypothetical protein  46.5 
 
 		 360 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3001  oxidoreductase domain-containing protein  41.06 
 
 		 349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.133367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3622  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  37.96 
 
 		 343 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000912709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2245  oxidoreductase domain-containing protein  37.39 
 
 		 342 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00745524  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1123  oxidoreductase domain-containing protein  45.38 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3878  oxidoreductase domain protein  43.5 
 
 		 349 aa  255  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0059  putative oxidoreductase  42.94 
 
 		 349 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3257  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.3 
 
 		 350 aa  250  2e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003594  predicted dehydrogenase  38.2 
 
 		 346 aa  250  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4442  oxidoreductase domain-containing protein  41.13 
 
 		 355 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0125  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.54 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3994  oxidoreductase YdgJ  42.54 
 
 		 350 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3306  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.46 
 
 		 367 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3064  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.46 
 
 		 367 aa  242  6e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  35.54 
 
 		 348 aa  241  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2998  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.54 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1539  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  42.54 
 
 		 350 aa  241  1e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1244  oxidoreductase domain-containing protein  35.1 
 
 		 346 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.173685 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3923  oxidoreductase YdgJ  42.54 
 
 		 350 aa  239  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.440604  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0040  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  36.57 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0135  oxidoreductase domain-containing protein  41.93 
 
 		 350 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3327  oxidoreductase-like  41.31 
 
 		 350 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0145  oxidoreductase domain-containing protein  41.88 
 
 		 350 aa  229  4e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550322  normal  0.534197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2907  oxidoreductase-like  40.23 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0148  oxidoreductase domain-containing protein  40.23 
 
 		 350 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1107  oxidoreductase domain protein  41.1 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4956  oxidoreductase domain protein  35.21 
 
 		 344 aa  224  3e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0161  oxidoreductase domain-containing protein  40.52 
 
 		 341 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0147  oxidoreductase domain-containing protein  41.67 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1454  oxidoreductase domain-containing protein  39.56 
 
 		 357 aa  218  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.872764  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02208  conserved expressed oxidoreductase (Eurofung)  34.99 
 
 		 360 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.380674  normal  0.661922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5750  oxidoreductase domain protein  35.39 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2007  oxidoreductase  37.42 
 
 		 336 aa  216  5e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0414834  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0451  oxidoreductase domain protein  39.06 
 
 		 363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1166  oxidoreductase domain-containing protein  35.31 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1736  oxidoreductase domain protein  34.71 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03887  YvaA  39.31 
 
 		 346 aa  207  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0179  oxidoreductase domain protein  41 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6869  oxidoreductase YdgJ  38.89 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3848  putative dehydrogenase  34.83 
 
 		 345 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3724  putative dehydrogenase  34.55 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3745  putative dehydrogenase  35.04 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3854  putative dehydrogenase  36.7 
 
 		 345 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6241  oxidoreductase domain protein  37.82 
 
 		 332 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3639  putative dehydrogenase  34.83 
 
 		 345 aa  189  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.117542  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4166  oxidoreductase domain protein  38.29 
 
 		 358 aa  189  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03291  predicted oxidoreductase with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  34.83 
 
 		 345 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0275  oxidoreductase domain protein  34.83 
 
 		 345 aa  189  8e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3918  putative dehydrogenase  34.83 
 
 		 345 aa  189  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03244  hypothetical protein  34.83 
 
 		 345 aa  189  8e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414276  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3914  putative dehydrogenase  39.18 
 
 		 345 aa  189  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.465022 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0273  putative dehydrogenase  34.83 
 
 		 345 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3812  putative dehydrogenase  36.39 
 
 		 345 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4757  putative dehydrogenase  34.55 
 
 		 345 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523048  normal  0.406172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>