More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5448 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5448  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  532  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.950541  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5899  hypothetical protein  83.59 
 
 
261 aa  441  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.583895 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2803  hypothetical protein  80.62 
 
 
266 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.632072  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6081  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  81.99 
 
 
266 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5378  hypothetical protein  81.57 
 
 
264 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441128  normal  0.860708 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2670  hypothetical protein  79.46 
 
 
266 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43080  hypothetical protein  58.82 
 
 
274 aa  313  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1715  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  57.81 
 
 
277 aa  298  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0752  hypothetical protein  56.47 
 
 
274 aa  294  9e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0201  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich protein  57.79 
 
 
267 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1766  hypothetical protein  55.73 
 
 
260 aa  278  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0364  hypothetical protein  52.73 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.228325  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0397  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  51.78 
 
 
253 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110974 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1421  cysteine-rich domain-containing protein  50.79 
 
 
250 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4689  hypothetical protein  50 
 
 
261 aa  253  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1375  hypothetical protein  50.2 
 
 
250 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267748  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1842  hypothetical protein  47.86 
 
 
265 aa  228  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00098228  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1413  hypothetical protein  45.9 
 
 
249 aa  217  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.170159  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0086  hypothetical protein  40.82 
 
 
245 aa  209  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0071  hypothetical protein  40.41 
 
 
246 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0112  hypothetical protein  40.41 
 
 
246 aa  205  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0140  hypothetical protein  45.02 
 
 
263 aa  204  9e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0717  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  43.27 
 
 
248 aa  202  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1024  hypothetical protein  41.39 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1454  cysteine-rich domain protein  38.46 
 
 
245 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00283589  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1206  hypothetical protein  43.98 
 
 
241 aa  196  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.546437  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0884  hypothetical protein  39.59 
 
 
244 aa  196  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3990  hypothetical protein  40.98 
 
 
239 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.441671  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1416  hypothetical protein  41.39 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1216  hypothetical protein  41.39 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0407054  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1194  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.39 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1196  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  41.39 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0498426  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1315  hypothetical protein  41.39 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1456  hypothetical protein  41.39 
 
 
239 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1392  hypothetical protein  41.39 
 
 
239 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1354  hypothetical protein  40.57 
 
 
239 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1218  hypothetical protein  40.57 
 
 
239 aa  191  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0392  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.15 
 
 
238 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0367  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.32 
 
 
259 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  46.12 
 
 
241 aa  188  7e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1935  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.92 
 
 
241 aa  188  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0152527 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1216  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  39.75 
 
 
244 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770234  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2080  hypothetical protein  42.68 
 
 
268 aa  187  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.945675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1274  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.25 
 
 
239 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  43.15 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1310  hypothetical protein  42.74 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0967  hypothetical protein  38.96 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1431  hypothetical protein  41.42 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.667811  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0867  hypothetical protein  41.42 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.258503  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2182  hypothetical protein  41.42 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0458  hypothetical protein  41.42 
 
 
268 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1873  hypothetical protein  41.42 
 
 
289 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3259  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.84 
 
 
240 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3164  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  40.96 
 
 
256 aa  183  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0555  Fe-S oxidoreductase  41.42 
 
 
268 aa  183  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1769  hypothetical protein  40.08 
 
 
266 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.329693  normal  0.0772008 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1464  hypothetical protein  42.92 
 
 
240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270606  normal  0.902058 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2222  hypothetical protein  44.16 
 
 
263 aa  182  6e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1547  hypothetical protein  43.75 
 
 
240 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.198081  normal  0.0351499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3263  hypothetical protein  38.43 
 
 
242 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3037  hypothetical protein  38.02 
 
 
242 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.291586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2958  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, iron-sulfur subunit  38.84 
 
 
242 aa  181  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3270  hypothetical protein  38.02 
 
 
242 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0818  hypothetical protein  40.41 
 
 
241 aa  178  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.212327  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3606  hypothetical protein  41.84 
 
 
270 aa  177  1e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2585  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  42.5 
 
 
240 aa  178  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.749181  hitchhiker  0.00208948 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2738  Fe-S oxidoreductase  45 
 
 
240 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1713  hypothetical protein  45 
 
 
240 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.8421  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2604  hypothetical protein  45 
 
 
240 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.186656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2660  hypothetical protein  45 
 
 
240 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3098  hypothetical protein  45 
 
 
240 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00812964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1494  hypothetical protein  45 
 
 
240 aa  175  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1096  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  41.91 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.757675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.82 
 
 
245 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1870  hypothetical protein  44.29 
 
 
240 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2148  hypothetical protein  42.92 
 
 
240 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11459  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0079  hypothetical protein  37.29 
 
 
260 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.376514  unclonable  0.0000154463 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2168  hypothetical protein  42.47 
 
 
240 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1139  hypothetical protein  42.59 
 
 
236 aa  169  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79138  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2041  hypothetical protein  42.47 
 
 
240 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.914482  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1896  Fe-S oxidoreductase  37.24 
 
 
256 aa  169  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.138109  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5437  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.01 
 
 
240 aa  168  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5946  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  42.01 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0860628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2131  hypothetical protein  42.01 
 
 
240 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.198327  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2926  hypothetical protein  40.65 
 
 
256 aa  165  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0345775  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1690  glycolate oxidase-like protein  37.44 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2995  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  40.16 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2677  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.11 
 
 
239 aa  161  9e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2282  hypothetical protein  43.33 
 
 
260 aa  159  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.293484  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0669  hypothetical protein  40.42 
 
 
243 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0954341  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4458  hypothetical protein  37.08 
 
 
247 aa  158  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.169961 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3589  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  38.87 
 
 
265 aa  156  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2718  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.89 
 
 
247 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1749  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.3 
 
 
239 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0856492  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1437  oxidoreductase  35.15 
 
 
246 aa  155  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.147364  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5452  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.68 
 
 
239 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0810  hypothetical protein  36.93 
 
 
249 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0233285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2593  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.66 
 
 
270 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.128565  normal  0.0827191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1397  hypothetical protein  38.65 
 
 
262 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0375  hypothetical protein  37.65 
 
 
289 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000724873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>