43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5347 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5347  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 422 aa  832    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.775837  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2731  polysaccharide biosynthesis protein  51.67 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 		 429 aa  204  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3487  polysaccharide biosynthesis protein  34.71 
 
 		 424 aa  182  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0265796 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  31.54 
 
 		 478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0743  polysaccharide biosynthesis protein  31.63 
 
 		 509 aa  168  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.197884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0076  polysaccharide biosynthesis protein  30.9 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.160586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0079  polysaccharide biosynthesis protein  30.9 
 
 		 499 aa  164  3e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.75242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1344  polysaccharide biosynthesis protein  31.83 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  31.2 
 
 		 473 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1073  polysaccharide biosynthesis protein  28.74 
 
 		 492 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.610845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4394  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 		 488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.681509  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3973  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 		 488 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3556  polysaccharide biosynthesis protein  29.34 
 
 		 488 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.225239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0694  polysaccharide biosynthesis family protein  29.11 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.731179  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3866  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 488 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377761  normal  0.957657 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2289  polysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2428  polysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3362  polysaccharide biosynthesis protein  29.21 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1969  polysaccharide biosynthesis protein  29.2 
 
 		 488 aa  127  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1706  polysaccharide biosynthesis family protein  28.64 
 
 		 488 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.974383  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0545  polysaccharide biosynthesis family protein  28.64 
 
 		 484 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1873  polysaccharide biosynthesis family protein  28.64 
 
 		 484 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1665  polysaccharide biosynthesis family protein  28.64 
 
 		 484 aa  126  7e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.702931  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0753  polysaccharide biosynthesis family protein  28.64 
 
 		 488 aa  126  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2229  polysaccharide transporter  29.48 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0925528 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2112  polysaccharide biosynthesis protein  28.64 
 
 		 498 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.306384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0750  polysaccharide biosynthesis protein  30.49 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4609  polysaccharide biosynthesis protein  28.9 
 
 		 488 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.286147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  25.97 
 
 		 486 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1966  polysaccharide biosynthesis protein  23.97 
 
 		 507 aa  67  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3724  O-antigen exporter/flippase  23 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2965  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 500 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 		 509 aa  50.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  31.48 
 
 		 448 aa  49.7  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2873  polysaccharide biosynthesis protein  32.95 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.354363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0767  O-antigen transporter-like  21.74 
 
 		 506 aa  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0678  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 499 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  26.79 
 
 		 483 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3181  polysaccharide biosynthesis domain-containing protein  21.01 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.04 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0934  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0952  polysaccharide biosynthesis protein  23.01 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489257  normal  0.594453 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>