20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3488 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  96.32 
 
 		 163 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  58.57 
 
 		 171 aa  140  6e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  37.61 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  35.46 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  35.46 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  42.05 
 
 		 483 aa  54.3  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  29.84 
 
 		 258 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  33.65 
 
 		 234 aa  52  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  34.78 
 
 		 237 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  36.22 
 
 		 176 aa  51.2  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  34.71 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  34.11 
 
 		 222 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  27.27 
 
 		 243 aa  48.9  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  30.11 
 
 		 478 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  27.19 
 
 		 302 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  28.07 
 
 		 302 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  31.52 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  28.41 
 
 		 240 aa  40.8  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  29.35 
 
 		 241 aa  40.4  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>