More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS04796 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_1029  sulfate permease family inorganic anion transporter  73.4 
 
 
570 aa  782    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141667  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4108  sulphate transporter  80.92 
 
 
573 aa  850    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.206174 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0137  sulfate permease family protein  73.4 
 
 
570 aa  782    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04796  putative sulfate transporter transmembrane protein  100 
 
 
567 aa  1110    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0178454 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1270  sulfate permease family protein  73.4 
 
 
570 aa  782    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.333072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1810  sulfate permease family inorganic anion transporter  73.4 
 
 
570 aa  782    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.251362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1962  sulfate permease family protein  73.23 
 
 
570 aa  781    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0829811  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1789  sulfate permease family protein  73.4 
 
 
570 aa  782    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.380427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4679  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  73.71 
 
 
576 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0998363  normal  0.237703 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1758  sulfate permease family inorganic anion transporter  73.4 
 
 
570 aa  782    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2524  sulfate permease family protein  73.36 
 
 
570 aa  766    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160455  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1715  sulphate transporter  73.26 
 
 
574 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1515  sulphate transporter  73.72 
 
 
571 aa  715    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.598133  normal  0.020255 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3995  sulphate transporter  80.92 
 
 
573 aa  850    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437247  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1059  sulphate transporter  73.54 
 
 
571 aa  714    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1461  sulphate transporter  73.8 
 
 
572 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.297634  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1421  sulphate transporter  73.71 
 
 
572 aa  690    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1539  sulphate transporter  73.54 
 
 
571 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6179  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  61.82 
 
 
562 aa  600  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4635  sulfate transporter  63.84 
 
 
578 aa  578  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258669  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2661  sulphate transporter  54.6 
 
 
541 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.955862  normal  0.879758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4170  sulphate transporter  44.61 
 
 
536 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0968  sulphate transporter  44.26 
 
 
548 aa  317  5e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.469942  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1050  sulphate transporter  44.07 
 
 
548 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.089361 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3021  sulfate transporter  36.49 
 
 
571 aa  252  1e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3841  sulphate transporter  37.82 
 
 
583 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723364  normal  0.0852274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3280  sulphate transporter  35.29 
 
 
590 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.362301  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0748  sulphate transporter  32.25 
 
 
556 aa  212  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0690  sulphate anion transporter  30.04 
 
 
583 aa  211  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  31.95 
 
 
560 aa  208  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  32.07 
 
 
588 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  31.51 
 
 
565 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  33.4 
 
 
576 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6591  sulfate transporter  30.77 
 
 
576 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  32.76 
 
 
572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0751  sulphate transporter  33.76 
 
 
573 aa  199  1.0000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.736424  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  32.84 
 
 
584 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3444  sulfate transporter  31.07 
 
 
575 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0027476  hitchhiker  0.000776053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4990  sulfate transporter  33 
 
 
592 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.143268  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1526  sulphate transporter  35.8 
 
 
570 aa  193  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.966412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4465  sulfate transporter  27.66 
 
 
573 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  32.67 
 
 
572 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1916  sulfate transporter  31.19 
 
 
580 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108162 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0049  sulphate transporter  32.44 
 
 
556 aa  189  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2274  sulphate transporter  32.5 
 
 
556 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4465  sulfate transporter  32.21 
 
 
590 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.52247  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5814  sulfate transporter  28.33 
 
 
565 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  31.3 
 
 
585 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3364  sulphate transporter  30.14 
 
 
596 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5012  sulfate transporter  29.49 
 
 
579 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.29259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  31.48 
 
 
599 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1291  sulphate transporter  32.18 
 
 
556 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4103  sulphate transporter  33.02 
 
 
551 aa  182  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1584  sulphate transporter  33.72 
 
 
556 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  28.52 
 
 
578 aa  181  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0756  sulfate transporter  28.77 
 
 
570 aa  180  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229837  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7075  sulphate transporter  30.41 
 
 
557 aa  179  9e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  28.81 
 
 
569 aa  179  9e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  28.81 
 
 
569 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5601  sulphate transporter  29.58 
 
 
582 aa  179  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.44 
 
 
571 aa  177  6e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0875  sulphate transporter  31.5 
 
 
576 aa  177  6e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.330873  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  27.91 
 
 
568 aa  176  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0718  sulfate transporter  28.88 
 
 
570 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  27.91 
 
 
568 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3720  sulfate transporter (permease)  28.63 
 
 
586 aa  176  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  28.08 
 
 
568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  30.19 
 
 
585 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0752  sulfate transporter  28.88 
 
 
570 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614638  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2316  sulfate permease family protein  30.89 
 
 
605 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.677051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  29.34 
 
 
590 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  29.67 
 
 
592 aa  172  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  30.53 
 
 
730 aa  171  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  28.96 
 
 
573 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3374  sulfate transporter  27.74 
 
 
595 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.468006  normal  0.96249 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1380  sulfate permease  28.76 
 
 
574 aa  169  2e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.446834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  28.68 
 
 
586 aa  169  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  32.89 
 
 
591 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1430  sulfate transporter  32.34 
 
 
566 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1055  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.93 
 
 
610 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.516115  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2031  sulfate permease family protein  30.93 
 
 
610 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2321  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.93 
 
 
610 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.986632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1341  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.93 
 
 
610 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2454  sulfate transporter  29.79 
 
 
587 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000318181  normal  0.0196593 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4975  sulfate transporter  31.89 
 
 
559 aa  163  9e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1427  ulfate transporter family protein  30.74 
 
 
610 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  31.32 
 
 
588 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3214  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.74 
 
 
610 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3088  sulfate permease family inorganic anion transporter  30.74 
 
 
610 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.447137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4041  sulphate transporter  30.04 
 
 
569 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3233  sulfate transporter  28.49 
 
 
575 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0712722 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5910  sulphate transporter  29.96 
 
 
585 aa  158  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.219176  normal  0.352923 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2329  sulphate transporter  30.3 
 
 
563 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.149148  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  26.57 
 
 
597 aa  155  1e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3713  sulphate transporter  30.04 
 
 
576 aa  155  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.85263  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  29.98 
 
 
605 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  27.59 
 
 
574 aa  153  5.9999999999999996e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20390  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  31.85 
 
 
550 aa  153  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.209673  normal  0.62053 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22210  sulfate permease-like transporter, MFS superfamily  28.33 
 
 
601 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.2603  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1705  sulphate transporter  30.48 
 
 
581 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.39466  normal  0.584505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>