36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0378 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0378  CysZ-like protein  100 
 
 		 249 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.953327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0474  CysZ-like protein  92.77 
 
 		 248 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0349  CysZ-like protein  89.75 
 
 		 247 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.317609  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0441  CysZ-like protein  78.95 
 
 		 251 aa  381  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0060  CysZ-like protein  75.61 
 
 		 246 aa  377  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.29129  normal  0.117031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0068  CysZ-like protein  76.02 
 
 		 246 aa  376  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0205  CysZ-like protein  69.48 
 
 		 250 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.611011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2691  hypothetical protein  44.59 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0238338  normal  0.25801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0368  protein of unknown function DUF540  43.16 
 
 		 238 aa  168  9e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0547  protein of unknown function DUF540  44.58 
 
 		 239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3442  CysZ-like protein  40.17 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0583  protein of unknown function DUF540  42.42 
 
 		 241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4022  CysZ-like protein  42.74 
 
 		 243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0573  hypothetical protein  41.99 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0177  CysZ-like protein  42.5 
 
 		 242 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0167  CysZ-like protein  43.72 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0160  CysZ-like protein  43.72 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2241  hypothetical protein  44.44 
 
 		 238 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00757602  normal  0.105456 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3841  CysZ-like protein  39.33 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3744  CysZ-like protein  39.42 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1152  hypothetical protein  40.52 
 
 		 237 aa  146  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1307  hypothetical protein  41.59 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1350  CysZ-like protein  36.36 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3566  hypothetical protein  36.13 
 
 		 226 aa  126  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0151  protein of unknown function DUF540  41.26 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.236012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3414  CysZ-like protein  37.71 
 
 		 250 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.585186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2467  hypothetical protein  35.47 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.29772 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0810  hypothetical protein  35.04 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0150  hypothetical protein  34.6 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.660436  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0370  hypothetical protein  36.02 
 
 		 231 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.775974  normal  0.439004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2628  hypothetical protein  30.47 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.0429489 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0694  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.444998  normal  0.0165633 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3162  hypothetical protein  31.8 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2176  hypothetical protein  33.55 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4648  hypothetical protein  34.87 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1878  transmembrane protein  27.45 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>