274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4489 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007778  RPB_4489  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
166 aa  341  2e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.410319  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4339  GCN5-related N-acetyltransferase  87.07 
 
 
147 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0386238  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0990  GCN5-related N-acetyltransferase  78.91 
 
 
148 aa  234  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0799  GCN5-related N-acetyltransferase  75 
 
 
148 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6940  putative acetyltransferase  66.44 
 
 
149 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.627337 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2745  GCN5-related N-acetyltransferase  66.9 
 
 
149 aa  191  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.798727  normal  0.0826635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3543  GCN5-related N-acetyltransferase  65.52 
 
 
153 aa  190  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  46.56 
 
 
162 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0845  GCN5-related N-acetyltransferase  43.15 
 
 
159 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.455582  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3147  GCN5-related N-acetyltransferase  39.6 
 
 
155 aa  93.6  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.757532  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4453  hypothetical protein  32.41 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.767162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4171  hypothetical protein  31.03 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2371  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 
161 aa  71.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2607  acetyltransferase  33.1 
 
 
142 aa  68.6  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4376  GCN5-related N-acetyltransferase  31.76 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.246785 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0039  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1998  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.55 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0762765  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3901  acetyltransferase  30.88 
 
 
143 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0744234  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  31.01 
 
 
170 aa  62.4  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2430  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 
145 aa  60.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.795815  normal  0.63662 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2531  GCN5-related N-acetyltransferase  27.97 
 
 
291 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.801418  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1855  acetyltransferase  32.91 
 
 
164 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212517 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2481  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000827608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  38 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0146  GCN5-related N-acetyltransferase  29.93 
 
 
147 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0731728  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3359  hypothetical protein  31.33 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4018  hypothetical protein  27.74 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.131237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03884  predicted acetyltransferase  27.74 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1621  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03844  hypothetical protein  27.74 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.194334  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3985  GCN5-related N-acetyltransferase  27.74 
 
 
147 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0469  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
147 aa  54.3  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2524  hypothetical protein  32.37 
 
 
167 aa  53.9  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.210905 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4246  hypothetical protein  31.45 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4554  hypothetical protein  31.45 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.321988  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1942  GCN5-related N-acetyltransferase  29.8 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.35373  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4517  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0536703  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5482  hypothetical protein  28.08 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0122  hypothetical protein  30.92 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0546577 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  41.33 
 
 
164 aa  53.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3786  hypothetical protein  28.19 
 
 
151 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4590  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2370  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 
161 aa  52.4  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.195178  normal  0.40215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0063  hypothetical protein  27.48 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800795  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4427  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4514  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4392  hypothetical protein  28.57 
 
 
145 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.72967  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2822  GCN5-related N-acetyltransferase  37 
 
 
144 aa  51.6  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333546  normal  0.163707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.631657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0724  acetyltransferase  22.96 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.268912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0174  hypothetical protein  26.95 
 
 
148 aa  51.6  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0020  hypothetical protein  28 
 
 
151 aa  51.2  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142061  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1677  GCN5-related N-acetyltransferase  28.29 
 
 
171 aa  51.2  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00114671  hitchhiker  0.00451269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2857  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.42306  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22280  acetyltransferase  48.39 
 
 
186 aa  51.2  0.000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3089  GCN5-related N-acetyltransferase  38.95 
 
 
146 aa  50.8  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.145585  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5353  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
166 aa  50.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.241243 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003788  transcriptional regulator  32.61 
 
 
140 aa  50.4  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00106887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  34.31 
 
 
164 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.810572  normal  0.111735 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 
149 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1179  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2340  GCN5-related N-acetyltransferase  30.66 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0091  GCN5-related N-acetyltransferase  26.28 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4133  hypothetical protein  27.33 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2063  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.660886 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2044  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001389  spermidine N1-acetyltransferase  26.32 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.091207  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4456  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.33 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6588  hypothetical protein  31.91 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.745421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45980  putative acetyltransferase  29.58 
 
 
143 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4128  GCN5-related N-acetyltransferase  30.95 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000338404  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.11 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1581  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.408261  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1945  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.93 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2076  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.2 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.591554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.47 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2169  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0666811  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2083  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0325128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3229  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2464  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2520  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.710408  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1356  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0397036  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06378  spermidine n1-acetyltransferase  30.1 
 
 
176 aa  48.5  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3433  GCN5-related N-acetyltransferase  32.19 
 
 
173 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4266  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136953  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2609  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.95 
 
 
491 aa  48.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1387  GCN5-related N-acetyltransferase  26.62 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.678698  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5293  hypothetical protein  32.98 
 
 
173 aa  47.8  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0283195 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4026  hypothetical protein  26.95 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3838  hypothetical protein  26.95 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02663  acetyltransferase  28.35 
 
 
171 aa  47.8  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2895  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
192 aa  47.8  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0142  GCN5-related N-acetyltransferase  27.94 
 
 
162 aa  47.8  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000142721  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3965  hypothetical protein  26.95 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.819942  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3649  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
162 aa  47.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3857  hypothetical protein  26.95 
 
 
146 aa  47.8  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0720  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
188 aa  47.4  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000642357  normal  0.302145 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2002  putative acetyltransferase  26.95 
 
 
165 aa  47.4  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0736  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
149 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>