41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2177 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2177  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  845    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0642236  normal  0.0211991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3255  hypothetical protein  72.7 
 
 		 404 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.217515 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6873  hypothetical protein  69.7 
 
 		 401 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.358007  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3719  hypothetical protein  31.34 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.429536  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0763  hypothetical protein  25.18 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4975  hypothetical protein  27.99 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.52355  hitchhiker  0.0000000664128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3251  hypothetical protein  24.65 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.18778 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1102  hypothetical protein  32.73 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4125  hypothetical protein  28.81 
 
 		 528 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02951  hypothetical protein  23.67 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0552  hypothetical protein  32.69 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.871819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1795  putative secreted lipase  28.88 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.325361  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1796  putative secreted lipase  28.45 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5090  hypothetical protein  28.23 
 
 		 527 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5769  esterase  30.28 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1291  putative secreted lipase  28.96 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1869  hypothetical protein  29.18 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.931797  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2212  hypothetical protein  25.5 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.438788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1355  hypothetical protein  28.42 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.158226  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3524  secretory lipase  28.14 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2478  secretory lipase  30.77 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1425  secretory lipase  30.23 
 
 		 417 aa  55.5  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283647  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3922  secretory lipase  29.71 
 
 		 366 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0253176  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3995  secretory lipase  27.71 
 
 		 427 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0441069 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0388  Triacylglycerol lipase  27.92 
 
 		 422 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0585  secretory lipase family protein  29.5 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.566733  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3330  secretory lipase  29.2 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1850  secretory lipase family protein  29.5 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.12811  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1013  putative secretory lipase  29.5 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1100  putative secretory lipase  29.5 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0883  secretory lipase family protein  29.5 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.644932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1828  hypothetical protein  29.19 
 
 		 538 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.637727 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2321  secretory lipase family protein  29.5 
 
 		 410 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2614  secretory lipase  26.67 
 
 		 427 aa  50.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0329  secretory lipase  29.66 
 
 		 417 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.282596 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1352  hypothetical protein  29.11 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2256  secretory lipase  31.09 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.454748  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0733  putative exported lipase  26.99 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1520  secretory lipase  23.91 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.200782  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0972  secretory lipase  26.97 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441802  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1435  secretory lipase  27.5 
 
 		 433 aa  43.1  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.765919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>