More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1048 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1048  sulphate transport system permease protein 1  100 
 
 		 348 aa  690    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1159  sulphate transport system permease protein 1  95.68 
 
 		 348 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.940545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0818  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  93.97 
 
 		 348 aa  655    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.650586  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  85.01 
 
 		 349 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  77.01 
 
 		 349 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3557  sulphate transport system permease protein 1  76.95 
 
 		 349 aa  540  9.999999999999999e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6974  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding component  78.39 
 
 		 345 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1391  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  63.29 
 
 		 350 aa  444  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  57.91 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 		 365 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  57.02 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.94 
 
 		 362 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.34 
 
 		 355 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.68 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.86 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1181  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  57.67 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.36202  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  55.52 
 
 		 362 aa  380  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.68 
 
 		 375 aa  378  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.22 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  57.31 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.26 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.34 
 
 		 356 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  57.26 
 
 		 352 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  55.4 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  55.11 
 
 		 329 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_004310  BR0110  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.07 
 
 		 359 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  56.52 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3690  sulphate transport system permease protein 1  55.81 
 
 		 355 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.76 
 
 		 330 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1759  sulphate transport system permease protein 1  53.97 
 
 		 367 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.95 
 
 		 371 aa  368  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.04 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1124  sulphate transport system permease protein 1  56.94 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1604  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.71 
 
 		 354 aa  369  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1581  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.94 
 
 		 352 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0107  putative sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.07 
 
 		 386 aa  368  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.14 
 
 		 374 aa  369  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  54.13 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4742  ABC sulfate transporter, ATPase subunit  56.66 
 
 		 352 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0517835  normal  0.707083 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.91 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.16 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.55 
 
 		 329 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.11 
 
 		 329 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.16 
 
 		 352 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.47 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.84 
 
 		 357 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.65 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  57.06 
 
 		 326 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.51 
 
 		 355 aa  363  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  54.7 
 
 		 372 aa  362  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  56.16 
 
 		 326 aa  362  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1968  sulphate transport system permease protein 1  56.02 
 
 		 378 aa  362  4e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.62 
 
 		 369 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1633  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.81 
 
 		 353 aa  362  4e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2257  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.29 
 
 		 352 aa  361  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0123  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  54.78 
 
 		 354 aa  361  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0622  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  57.87 
 
 		 365 aa  360  2e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 		 352 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.98 
 
 		 329 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.98 
 
 		 329 aa  358  6e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5390  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.2 
 
 		 345 aa  358  6e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  52.82 
 
 		 354 aa  358  8e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.58 
 
 		 367 aa  358  9e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.78 
 
 		 369 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3403  sulphate transport system permease protein 1  57.14 
 
 		 356 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.270321  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1378  sulphate transport system permease protein 1  54.8 
 
 		 367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.747382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2477  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.24 
 
 		 351 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.252738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1850  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.09 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.515389  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1695  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.09 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0693572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1206  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.09 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0375351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2017  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.09 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0351  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.09 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0503358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0809  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  56.09 
 
 		 351 aa  354  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.488207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  55.77 
 
 		 351 aa  354  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  51.82 
 
 		 357 aa  352  5e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  54.71 
 
 		 352 aa  352  7e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1080  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.99 
 
 		 363 aa  348  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.14 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 357 aa  346  3e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.57 
 
 		 357 aa  345  6e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  50.57 
 
 		 357 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5846  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.59 
 
 		 346 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  64.09 
 
 		 369 aa  342  7e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.3 
 
 		 346 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  58.25 
 
 		 351 aa  338  9.999999999999999e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  52.87 
 
 		 371 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.87 
 
 		 371 aa  333  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.57 
 
 		 374 aa  332  6e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  51.73 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  63.45 
 
 		 338 aa  330  3e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1302  sulfate/thiosulfate transporter subunit  58.48 
 
 		 363 aa  329  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.807045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1411  sulfate/thiosulfate transporter subunit  58.48 
 
 		 363 aa  329  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.87 
 
 		 359 aa  328  9e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  55.28 
 
 		 351 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  55.22 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2766  sulfate/thiosulfate transporter subunit  58.13 
 
 		 363 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5476  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  52.46 
 
 		 376 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.351267  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1096  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 		 376 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0994  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  53.42 
 
 		 376 aa  326  3e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>