81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2365 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  307  4e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  60.51 
 
 
165 aa  207  4e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  60.51 
 
 
165 aa  192  1e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  44.97 
 
 
154 aa  134  6e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  42.95 
 
 
147 aa  112  2e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  39.01 
 
 
152 aa  108  4e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  41.96 
 
 
150 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0323  protein of unknown function DUF107  43.9 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0296  protein of unknown function DUF107  45.53 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3109  protein of unknown function DUF107  46.58 
 
 
148 aa  92.8  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00574825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0320  protein of unknown function DUF107  43.9 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  35.71 
 
 
151 aa  89.4  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  38.69 
 
 
143 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  36.88 
 
 
145 aa  87  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  37.59 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  36.88 
 
 
145 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0261  hypothetical protein  36.96 
 
 
146 aa  82.8  2e-15  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  34.25 
 
 
150 aa  63.9  8e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  28.79 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  28.79 
 
 
142 aa  60.1  1e-08  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  28.79 
 
 
142 aa  58.9  2e-08  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  28.79 
 
 
142 aa  58.9  2e-08  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  59.3  2e-08  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  59.3  2e-08  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  29.55 
 
 
142 aa  59.7  2e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  58.5  3e-08  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.79 
 
 
142 aa  57.8  5e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  29.93 
 
 
143 aa  57.8  5e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  56.6  1e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  29.25 
 
 
153 aa  56.6  1e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  29.37 
 
 
147 aa  55.5  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  30.22 
 
 
145 aa  55.5  3e-07  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  29.37 
 
 
147 aa  55.5  3e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  26.52 
 
 
142 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  29.25 
 
 
148 aa  54.7  5e-07  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  30.77 
 
 
154 aa  53.5  1e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  31.08 
 
 
150 aa  52.8  2e-06  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  30.07 
 
 
143 aa  52.8  2e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  28.17 
 
 
153 aa  52  3e-06  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25.17 
 
 
152 aa  52  4e-06  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.14 
 
 
140 aa  51.2  6e-06  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  30.14 
 
 
140 aa  50.8  8e-06  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  29.58 
 
 
148 aa  49.3  2e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  28.47 
 
 
151 aa  49.3  2e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  28.15 
 
 
149 aa  48.1  4e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  30.53 
 
 
152 aa  47.8  6e-05  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  30.95 
 
 
151 aa  47.8  7e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  30.95 
 
 
151 aa  47.8  7e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.14 
 
 
147 aa  47.4  8e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  29.77 
 
 
152 aa  47.4  9e-05  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  30.95 
 
 
152 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  30.95 
 
 
152 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  30.95 
 
 
152 aa  47  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  30.95 
 
 
152 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  28.87 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  30.95 
 
 
152 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  7.72435e-05 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  26.39 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.61 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.89934e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  27.81 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  24.32 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  32.38 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  32.64 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  32.64 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  27.08 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  27.7 
 
 
153 aa  43.9  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  3.02368e-07 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  33.56 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  27.81 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  30.41 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  27.1 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  27.15 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  25.49 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  27.46 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  31.88 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  37.5 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  25.49 
 
 
155 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  29.33 
 
 
143 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  28.57 
 
 
150 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  27.81 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  31.43 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  31.08 
 
 
121 aa  41.2  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>