79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3644 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  53.26 
 
 		 92 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  58.7 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  55.43 
 
 		 101 aa  106  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  53.26 
 
 		 92 aa  102  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  54.84 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  54.84 
 
 		 93 aa  101  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  54.84 
 
 		 93 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  55.43 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  55.43 
 
 		 92 aa  100  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  51.69 
 
 		 92 aa  97.1  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  47.83 
 
 		 92 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  53.26 
 
 		 92 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  48.31 
 
 		 92 aa  83.6  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  42.59 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42010  hypothetical protein  57.14 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  41.3 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  41.3 
 
 		 92 aa  77.4  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  38.38 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1591  plasmid maintenance system killer  38.04 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0593652  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  36.26 
 
 		 94 aa  65.5  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  38.64 
 
 		 96 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  38.64 
 
 		 96 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  41.76 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  39.77 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  65.79 
 
 		 51 aa  62.4  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  43.33 
 
 		 61 aa  61.6  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  39.77 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  35.16 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 93 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4746  plasmid maintenance system killer  42.11 
 
 		 90 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0088  plasmid maintenance system killer protein  33.71 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.167827  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0090  plasmid maintenance system killer  33.71 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  32.22 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2525  plasmid maintenance system killer  34.78 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0385554  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1257  plasmid maintenance system killer  38.95 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0146502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1064  plasmid maintenance system killer  41.46 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  36.56 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0833  plasmid maintenance system killer  38.95 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.463339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3199  plasmid maintenance system killer  37.63 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.477235  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  50.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000000964732  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  30 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1907  plasmid maintenance system killer  30.11 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000193605  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3069  plasmid maintenance system killer  38.1 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2928  plasmid maintenance system killer  34.44 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0275  plasmid maintenance system killer  39.02 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.292531  normal  0.0660179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2650  plasmid maintenance system killer  39.02 
 
 		 98 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.839642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0643  hypothetical protein  30.16 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000000101357  normal  0.456148 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6219  plasmid maintenance system killer  35.48 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.330477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  29.21 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4917  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.131575 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6420  plasmid maintenance system killer  40.32 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.953679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03904  plasmid maintenance system killer protein  36.51 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.462774  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0930  putative killer protein  33.66 
 
 		 117 aa  45.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  32.22 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27680  Plasmid maintenance system killer protein  38.71 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2880  plasmid maintenance system killer  33.8 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.474042  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  34.41 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  27.78 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  36.36 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0223  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.642238  normal  0.270748 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1668  plasmid maintenance system killer  35.87 
 
 		 92 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.856327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2941  plasmid maintenance system killer  37.1 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00442539  hitchhiker  0.00124461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3425  plasmid maintenance system killer  28.57 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.835038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1376  plasmid maintenance system killer  28.57 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4677  plasmid maintenance system killer  32.43 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0978715  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  34.85 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3242  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0554672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0276  killer suppression protein HigA, putative  37.18 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.853407  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  28.79 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0413  plasmid maintenance system killer  26.88 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2830  plasmid maintenance system killer  36.25 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5480  plasmid maintenance system killer  33.78 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2762  plasmid maintenance system killer  31.18 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2763  plasmid maintenance system killer  38.6 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.686339  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0273  plasmid maintenance system killer  36.51 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.1826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0767  plasmid maintenance system killer  37.1 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>