46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1485 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1485  plasmid maintenance system killer  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2778  plasmid maintenance system killer  79.17 
 
 		 96 aa  167  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.460932  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0577  plasmid maintenance system killer  79.17 
 
 		 96 aa  165  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2424  plasmid maintenance system killer  45.83 
 
 		 95 aa  95.9  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228875  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2424  plasmid maintenance system killer  47.92 
 
 		 96 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5381  plasmid maintenance system killer  42.55 
 
 		 101 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0821109  hitchhiker  0.0023513 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3242  plasmid maintenance system killer  41.57 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0235263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0570  plasmid maintenance system killer  42.55 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4450  plasmid maintenance system killer  40.43 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6999  plasmid maintenance system killer  37.23 
 
 		 94 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.17446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4499  plasmid maintenance system killer  39.33 
 
 		 111 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.538782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0360  plasmid maintenance system killer  38.95 
 
 		 93 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1143  proteic killer suppression protein  38.95 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0404  proteic killer suppression protein  38.95 
 
 		 93 aa  67.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0438  plasmid maintenance system killer  41.49 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.275617  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2470  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3084  plasmid maintenance system killer  35.11 
 
 		 92 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3644  plasmid maintenance system killer  39.77 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.018062  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0022  plasmid maintenance system toxin protein HigB  36.46 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00990261  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0423  proteic killer protein, putative  32.58 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6434  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.281041 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3837  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2890  plasmid maintenance system killer  32.98 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.320919  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1454  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 114 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.046849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4827  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4041  plasmid maintenance system killer  31.25 
 
 		 101 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4147  plasmid maintenance system killer  31.91 
 
 		 92 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.813098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3764  plasmid maintenance system killer  50 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1124  plasmid maintenance system killer  32.58 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000991255  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3936  plasmid maintenance system killer  32 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.108034 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2973  plasmid maintenance system killer  35.21 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2504  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000281555  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0044  plasmid maintenance system killer  34.04 
 
 		 92 aa  44.3  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1061  plasmid maintenance system killer  28.72 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000720973 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1670  plasmid maintenance system killer protein  33.82 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.137882  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0534  AAA family ATPase  33.82 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.943308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1106  plasmid maintenance system killer  28.17 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.458841  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2429  plasmid maintenance system killer  43.9 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.110388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2694  plasmid maintenance system killer  33.33 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2183  plasmid maintenance system killer  30.85 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454111  unclonable  0.000000258126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0607  plasmid maintenance system killer  31.43 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1092  hypothetical protein  34.29 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1311  plasmid stabilization system protein  51.52 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.648885  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0276  killer suppression protein HigA, putative  27.03 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.853407  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2851  plasmid maintenance system killer  30.67 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42020  hypothetical protein  48.72 
 
 		 51 aa  40  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>